Fuuka Yamagishi, eine zurückhaltende und schüchterne Schülerin des zweiten Jahres an der Gekkoukan High School, schließt sich dem Specialized Extracurricular Execution Squad (SEES) an. Ziel von Mobbing durch Mitschüler wie Natsuki Moriyama, erlitt sie einen Vorfall, bei dem Natsuki sie im Schulgymnastikraum einsperrte. Dies führte dazu, dass sie während der Dark Hour versehentlich in Tartarus gefangen war, wo sie zehn Tage lang allein überlebte, bevor SEES sie rettete. Dieses traumatische Erlebnis weckte ihre Persona-Fähigkeit, die Beschwörung von Lucia. Nach ihrer Rettung übernimmt Fuuka die Rolle der SEES-Navigatorin von Mitsuru Kirijo. Ihre Persona-Fähigkeiten konzentrieren sich ausschließlich auf Analyse und Unterstützung. Sie leistet entscheidende taktische Hilfe, indem sie Schwächen des Feindes scannt, Boss-Positionen vorhersagt, den Status der Gruppe überwacht und Echtzeit-Kommentare zum Schlachtfeld liefert. Ihre Fähigkeiten decken Feind-Affinitäten und Fertigkeitensets auf, wobei spätere Fähigkeiten wie Healing Wave die HP der Gruppe während des Tartarus-Aufstiegs wiederherstellen. Eine zweite Persona-Erweckung am 20. Oktober entwickelt Lucia zu Juno und gewährt Zugriff auf die Fähigkeit Oracle. Oracle liefert zufällige Effekte, einschließlich vollständiger HP/SP-Wiederherstellung oder Heilung von Leiden, birgt aber potenzielle Risiken. Fuuka durchläuft ein bedeutendes persönliches Wachstum. Trotz ihres Traumas vergibt sie Natsuki für das Mobbing und schützt sie vor Shadows, was ihre Versöhnung und spätere Freundschaft ermöglicht. Ihre Zeit bei SEES fördert zunehmendes Selbstvertrauen und Willenskraft und verwandelt sie von einem zurückgezogenen Opfer in eine widerstandsfähige und mitfühlende Person. Diese Entwicklung wird nach dem Tod von Shinjiro Aragaki im Oktober auf die Probe gestellt; sie empfindet Schuld über sein Opfer, erholt sich aber allmählich mit der Unterstützung ihrer Teammitglieder. Natsukis späterer Schulwechsel stellt eine weitere emotionale Herausforderung dar. Sie besitzt eine starke Affinität für Technologie und Computer und arbeitet häufig an ihrem Laptop im Wohnheim. Fuuka demonstriert fortgeschrittene Hacking-Fähigkeiten, greift auf eingeschränkte Kirijo Group-Dateien zu, um Tartarus-Wahrheiten aufzudecken, und rekonstruiert gelöschte Video-Nachrichten. Zu ihren Interessen gehört Hard Science-Fiction, was ihren analytischen Geist widerspiegelt. Allerdings hat sie Schwierigkeiten mit traditionell weiblichen Aktivitäten wie Kochen, macht oft Zutatenfehler trotz Versuchen, sich zu verbessern. Ihr familiärer Hintergrund schürt ihre Unsicherheiten; ihre Eltern, aus einer Familie von Ärzten, üben akademischen Druck aus, der von ihren eigenen Minderwertigkeitskomplexen herrührt. Dies schafft ein stressiges Zuhause, weshalb Fuuka das SEES-Wohnheim vorzieht, wo sie sich wertgeschätzt und nützlich fühlt. Optisch hat Fuuka kurzes blaugrünes Haar. Sie trägt typischerweise die Winteruniform der Gekkoukan High mit einem blaugrünen gemusterten Rollkragenpullover, weißen Strumpfhosen und braunen Loafers. Ihre Freizeitkleidung besteht aus einem hellgrünen Poncho über einem schwarzen Rollkragenpullover, einem knielangen Rock, schwarzen Leggings und Stiefeletten. In Tartarus-Kampfszenarien verwendet sie Funkkopfhörer für die Kommunikation. Über die Navigation hinaus repräsentiert Fuuka das Priestess-Arkana, das ihre kontemplative Natur, Unabhängigkeit und den Wunsch, Menschen zu verbinden, symbolisiert, was sich in ihrem Glauben widerspiegelt, dass ihre Persona „die Kraft gibt, Menschen zu verbinden, auch wenn sie getrennt sind.“