Kenji Minahaya ist ein junger Auszubildender und Besatzungsmitglied an Bord des neu in Dienst gestellten U-Boots 707 II, das unter dem Kommando von Kapitän Youhei Hayami steht. Zusammen mit seinen Mitrekruten Goro Kusaka und Senta Umino beteiligt er sich an Marineoperationen gegen die Organisation Undersea Silence Revolution als Teil der U-Boot-Flotte der Friedenserhaltenden Marine während Auseinandersetzungen mit feindlichen Kräften.