Cyrus befehligt Team Galaktik in seinem Streben nach einem neuen Universum, das vom Geist gereinigt ist, überzeugt davon, dass Emotionen Unvollkommenheit und Konflikte hervorbringen. Um dies zu erreichen, strebt er danach, die Macht von Dialga und Palkia, den legendären Pokémon, die über Zeit und Raum herrschen, zu nutzen. Am Speersäule des Coronet-Berges verwendet er Artefakte, bekannt als die Roten Ketten, um diese Gottheiten zu beschwören und zu kontrollieren, und befiehlt ihnen, die bestehende Realität aufzulösen. Sinnohs Champion Cynthia trifft ein, um einzugreifen, scheitert jedoch, den Prozess aufzuhalten. Cyrus’ Plan zerbricht, als Giratina, ein legendäres Pokémon, das mit Antimaterie verbunden ist, ein Becken der Dunkelheit unter Dialga und Palkia aufreißt. Cyrus bleibt ungerührt und befiehlt seinen Gefangenen, den Eindringling anzugreifen. Giratina schlägt zurück, zerstört die Roten Ketten und befreit das legendäre Duo. Dann packt es Cyrus und zieht ihn in seine eigene Welt, die Schattenwelt. In dieser Welt erwachend, findet Cyrus eine öde Weite aus treibenden Felsformationen und toten Bäumen vor, die der Schwerkraft trotzen. Kein anderes Leben regt sich. Giratina beobachtet schweigend. Cyrus überblickt die Umgebung und erkennt sie als die perfekte Welt, die er sich vorgestellt hat – eine, die keinen Geist benötigt. Er spricht Giratina an und fragt, ob es zufrieden ist, nachdem es seine Ambitionen vereitelt hat, und begreift allmählich, dass diese verzerrte Realität seine Vision erfüllt. Ein leichtes Lächeln zeigt sich auf seinem Gesicht, als er dieses Ergebnis akzeptiert. Währenddessen versucht sein Stellvertreter Saturn, Funkkontakt vom Hauptquartier von Team Galaktik herzustellen. Cyrus übermittelt eine letzte Nachricht, in der er Saturn anweist, nicht nach ihm zu suchen, gefolgt von einem unheimlichen Brüllen Giratinas. Saturn bestätigt den Befehl und bricht die Kommunikationsversuche ab. Cyrus verbleibt in der Schattenwelt und nimmt seinen ewigen Aufenthalt in dem, was er als die perfektionierte Existenz betrachtet, an.