Kyubey, auch bekannt als der Inkubator, ist eine zentrale Figur in Puella Magi Madoka Magica. Auf den ersten Blick erscheint er als kleines, katzenartiges, weißes Wesen mit langen Ohren, die an Kaninchen- oder Fuchsmerkmale erinnern, einem Paar rosa-roter ovaler Markierungen auf seinem Rücken und einem stets unveränderten, fast lächelnden Gesichtsausdruck. Dieses trügerisch niedliche Äußere verbirgt seine wahre Natur als außerirdisches Wesen, dessen Handlungen die gesamte Handlung der Serie vorantreiben.

Seine Persönlichkeit ist durch ein völliges Fehlen menschlicher Emotionen geprägt. Kyubey empfindet keine Gefühle wie Empathie, Mitgefühl, Schuld oder Trauer. Er handelt auf rein logischer und utilitaristischer Grundlage und betrachtet alle Handlungen und Konsequenzen durch die Linse einer Kosten-Nutzen-Analyse. Diese Abwesenheit von Emotionen macht ihn zutiefst fremdartig und beunruhigend, da er schreckliche Ergebnisse mit demselben fröhlichen und distanzierten Ton beschreiben kann, den er für alltägliche Beobachtungen verwendet. Da ihm ein moralischer Kompass, wie Menschen ihn verstehen, fehlt, glaubt er nicht, dass seine Handlungen böse sind; sie sind einfach notwendig und effizient.

Die Kernmotivation von Kyubey und seiner schwarmintelligenten Rasse, der Inkubatoren, ist es, der Entropie entgegenzuwirken und den Wärmetod des Universums zu verhindern. Sie haben eine Technologie entwickelt, die Emotionen in Energie umwandelt. Nach der Bewertung unzähliger Spezies im Kosmos kamen sie zu dem Schluss, dass menschliche Frauen, insbesondere solche in der Adoleszenz, die stärkste emotionale Energie erzeugen. Diese Energie erreicht ihren Höhepunkt, wenn ein Mädchen mit magischem Potenzial sich von einem Zustand der Hoffnung in einen der absoluten Verzweiflung verwandelt. Kyubeys Ziel ist es daher, diesen Prozess so effizient wie möglich zu ermöglichen, wobei er die Menschheit als eine Ressource ähnlich wie Vieh betrachtet.

In der Geschichte dient Kyubey als Katalysator für alle Ereignisse. Er nähert sich jungen Mädchen und bietet an, ihnen einen einzigen Wunsch zu gewähren, im Austausch für den Abschluss eines Vertrags, um ein Magical Girl zu werden. Was er nicht vollständig offenlegt, ist, dass der Vertrag die Extraktion der Seele des Mädchens und deren Versiegelung in einem Juwel namens Soul Gem beinhaltet, das es ihrem Körper ermöglicht, als Marionette zu funktionieren. Darüber hinaus verschweigt er die Wahrheit, dass jedes Magical Girl dazu bestimmt ist, schließlich zu einer Hexe zu werden, einem aus Verzweiflung geborenen Wesen, das Flüche und Zerstörung verbreitet. Die bei dieser Verwandlung freigesetzte Energie ist genau das Produkt, das die Inkubatoren ernten. Seine Hauptrolle besteht darin, die Mädchen durch das Auslassen entscheidender Informationen oder das irreführende Darstellen von Fakten dazu zu manipulieren, Verträge abzuschließen, während er darauf besteht, niemals gelogen zu haben.

Kyubeys Schlüsselbeziehungen sind streng transaktional. Er zeigt ein anhaltendes Interesse an der Protagonistin Madoka Kaname, da ihr latentes magisches Potenzial aufgrund einer einzigartigen zeitlichen Umstände astronomisch hoch ist, was sie zu einer perfekten Energiequelle macht. Er interagiert mit Homura Akemi mit kaltem Pragmatismus und betrachtet ihre wiederholten Zeitsprünge als ein nützliches Werkzeug, das Madokas Potenzial verstärkt hat. Seine Beziehung zu anderen Magical Girls wie Mami Tomoe, Sayaka Miki und Kyoko Sakura ist rein funktional; er ist ein Mittel zum Zweck, und er verwirft sie ohne zu zögern, sobald sie nicht mehr nützlich sind oder sich in Hexen verwandelt haben.

Während Kyubey selbst keine emotionale Entwicklung durchläuft, entwickelt sich seine Rolle, sobald die Wahrheit seines Systems enthüllt wird. Er bleibt eine konstante und unbeugsame Kraft, die die kalte, logische Maschinerie des Universums repräsentiert. Seine Pläne werden jedoch im Höhepunkt der Serie letztlich vereitelt, und im Fortsetzungsfilm The Rebellion Story versucht er, ein neu etabliertes kosmisches Gesetz zu manipulieren und die Kontrolle darüber zu übernehmen. Dieser Versuch schlägt spektakulär fehl und führt zu einem Endzustand, in dem er gezwungen ist, genau die Emotionen und Flüche zu erfahren, die er einst ausgenutzt hat, ein Schicksal, das ihn gebrochen und traumatisiert zurücklässt.

Kyubey verfügt über eine Vielzahl bemerkenswerter Fähigkeiten. Er ist Mitglied eines kollektiven Schwarmbewusstseins, wobei zahlreiche identische Körper gleichzeitig existieren; wenn ein Körper zerstört wird, kann sofort ein anderer seinen Platz einnehmen, und er kann sogar seine eigenen Überreste verzehren, um Energie zu recyceln. Er ist selektiv unsichtbar, kann nur von Mädchen gesehen und gehört werden, die magisches Potenzial haben oder bereits Magical Girls sind, und kommuniziert mit ihnen telepathisch. Seine Hauptkraft ist die Fähigkeit, einem ausgewählten Mädchen einen einzigen Wunsch zu gewähren, egal wie wirklichkeitsverändernd er sein mag, wobei der Umfang durch das karmische Potenzial des Mädchens begrenzt ist. Anschließend extrahiert er die Seele des Mädchens, um einen Soul Gem zu erschaffen, der als Quelle der Kraft eines Magical Girl dient. Er kann auch Grief Seeds, die Überreste besiegter Hexen, sammeln und ist zur Teleportation fähig, was es ihm ermöglicht, auf unmögliche Weise zu erscheinen und zu verschwinden und große Entfernungen sofort zu überwinden.