In Fullmetal Alchemist ist eine Chimäre ein Geschöpf, das durch einen Zweig der Bio-Alchemie erschaffen wird, der zwei oder mehr verschiedene Lebewesen zu einer einzigen neuen Form verschmilzt. Während die Synthese nicht-menschlicher Chimären ein legitimes, wenn auch schwieriges Forschungsfeld ist, gilt die Erschaffung einer menschlichen Chimäre, bei der ein Mensch mit einem Tier verschmolzen wird, als verbotene Form der Menschentransmutation. Diese Kreaturen weisen oft physische Merkmale und Fähigkeiten auf, die von den für ihre Erschaffung verwendeten Tieren stammen.

Die Figur, die am berühmtesten mit dem Begriff Chimäre verbunden ist, ist Nina Tucker, die junge Tochter des Staatsalchemisten Shou Tucker. Verzweifelt bemüht, seine staatliche Zertifizierung zu behalten, verwendete Shou Tucker seine eigene Tochter und ihren Hund Alexander als Bestandteile für eine neue Chimäre, die der menschlichen Sprache fähig war. Dieses tragische Ereignis dient als entscheidender Moment in der Geschichte, da die Brüder Elric sich mit Nina anfreunden, nur um die entsetzliche Wahrheit ihrer Verwandlung zu entdecken. Die Chimäre behält Ninas Bewusstsein und Sprachfähigkeit, ruft die Brüder in einem Zustand des Leidens an, was sie tief prägt und die schwerwiegenden Konsequenzen alchemistischer Hybris verstärkt. Dieser Vorfall ist nicht einzigartig, da sich herausstellt, dass Tucker Jahre zuvor dasselbe Verfahren an seiner Frau durchgeführt hatte, um seine ursprüngliche staatliche Zertifizierung zu erreichen.

Jenseits der Tuckers erscheinen andere menschliche Chimären als bedeutende Charaktere. Eine Gruppe von ihnen ist mit dem Homunkulus Greed verbunden und operiert von einer Bar namens Teufelsnest aus. Diese Chimären, darunter Personen namens Martel, Dorchet, Loa und Bido, haben stabilere menschenähnliche Formen, können sich aber teilweise verwandeln, um verbesserte physische Fähigkeiten wie Krallen oder Reptilienmerkmale zu erlangen. Ihre Motivationen entspringen oft dem Wunsch nach Freiheit oder der Wiedererlangung ihrer Menschlichkeit, was einige dazu bringt, sich mit verschiedenen Fraktionen innerhalb des Militärs oder mit den Brüdern Elric zu verbünden. Anders als die monströse, gequälte Schöpfung von Shou Tucker werden diese Chimären als kohärente Individuen dargestellt, die im größeren Konflikt ihre eigenen Entscheidungen treffen, obwohl sie immer noch von den unethischen Experimenten gezeichnet sind, die sie erschufen.

Die Fähigkeiten einer Chimäre hängen vollständig von den Spezies ab, aus denen sie zusammengesetzt ist. Standardmäßige, nicht-menschliche Chimären werden oft als mächtige Wächter eingesetzt, die die Stärke und Wildheit von Bestien wie Löwen oder Reptilien besitzen. Menschliche Chimären zeigen ein breites Spektrum an Fähigkeiten. Einige, wie die fehlgeschlagenen Experimente, sind verzerrte, unvollständige Wesen in ständigem Schmerz mit eingeschränkter sozialer Funktion. Erfolgreichere menschliche Chimären, wie diejenigen, die für das Militär oder Greed arbeiten, können verbesserte Sinne, übermenschliche Stärke und die Fähigkeit zeigen, tierische Merkmale wie scharfe Krallen, Reißzähne oder gepanzerte Häute zu manifestieren. Die fortschrittlichsten Erfolge können nach Belieben zwischen einem vollständig menschlichen Aussehen und einer mächtigen Mensch-Tier-Hybridform wechseln. Diese Individuen dienen als Soldaten, Spione oder Vollstrecker, ihre Existenz ein düsteres Zeugnis der geheimen und unmenschlichen Forschungsprogramme des Militärs.