Alitas Eintritt in die Welt des Motorballs markiert eine bedeutende Wende in ihrem Leben, da er sowohl eine Flucht vor persönlicher Tragödie als auch eine neue Arena darstellt, in der sie ihre beeindruckenden Kampffähigkeiten testen kann. Nach dem Tod von Yugo flieht eine trauernde und emotional zerrüttete Alita aus dem Zuhause ihrer Vaterfigur Daisuke Ido. Sie wird in einer Bar von einem ehemaligen Top-Liga-Spieler namens Esdoc entdeckt, der ihr Potenzial erkennt und sie überredet, ihren Schmerz und ihre Wut in den brutalen, schnellen Sport zu kanalisieren, und sie mit einem Zwölf-Rennen-Vertrag ausstattet. Diese Zeit stellt eine bewusste Entscheidung dar, ihre Vergangenheit zu begraben und sich im erbarmungslosen Wettkampf der Rennstrecke zu verlieren.

In der Welt der Scrapyard ist Motorball der beliebteste und gefährlichste Sport, ein Gladiatorenrennen, bei dem Cyborg-Wettkämpfer mit geschärften Waffen und immenser Geschwindigkeit um einen Ball kämpfen, um ihn über eine Ziellinie zu tragen. Für Alita ist Motorball mehr als nur ein Spiel; es ist ein Schmelztiegel. Der intensive Druck und die lebensbedrohliche Gefahr der Rennen lösen Gedächtnisfragmente ihrer vergessenen Vergangenheit als Mars-Kriegerin aus, wodurch ihr Streben nach Sieg zu einer Suche nach ihrer eigenen verlorenen Identität wird. Sie steigt schnell durch die Ränge der Dritten Liga auf und wird zu einer gefeierten und gefürchteten Spielerin, die für ihre unvergleichliche Fähigkeit bekannt ist. Ihr neues Leben wird von einem Mechaniker namens Ed unterstützt, der für sie die legendäre Damaszener Klinge schmiedet, eine Waffe, die untrennbar mit ihrem Kampfgeist verbunden wird.

Alitas Persönlichkeit während ihrer Motorball-Karriere ist durch eine kühle, fokussierte Distanziertheit geprägt. Sie bricht bewusst die Verbindungen zu ihrem früheren Leben ab, ignoriert Ido deutlich, als er sie auf der Rennstrecke entdeckt, ihr Blick eine klare Botschaft, dass sie einen anderen Weg gewählt hat. Diese Zeit zeigt ihre rohe, fast instinktive Liebe zum Kampf und ihren unermüdlichen Antrieb, sich bis an die Grenzen zu pushen. Ihre Motivationen sind komplex: Sie sucht den Rausch des Kampfes, der es ihr ermöglicht, sich lebendig zu fühlen und auf ihre verborgenen Erinnerungen zuzugreifen, während sie sich gleichzeitig für die erlittenen Verluste bestraft. Der Höhepunkt ihrer Motorball-Reise ist ihr letztes und größtes Match gegen Jashugan, den unbesiegten Top-Liga-Champion. In einem Kampf, der beide an ihre physischen und spirituellen Grenzen bringt, wird Alita besiegt, verdient sich aber den Respekt des Champions und überlebt, wodurch sie standardmäßig zur neuen Championin wird.

Ihre Schlüsselbeziehungen während dieser Zeit sind eher funktional als emotional. Sie wird von Esdoc gemanagt und von ihrem Mechaniker Ed betreut, der zu einem entscheidenden Verbündeten wird. Ihre bedeutendste Beziehung auf der Strecke ist die zu ihrem Rivalen Jashugan, einem Meister der spirituellen Energie (Chi), der die Grenzen seines Cyborg-Körpers transzendiert. Ihr Kampf ist ein entscheidender Moment gegenseitiger Anerkennung und Respekts, der Alita hilft, ein gewisses Maß an Frieden zu finden. Der Motorball-Bogen endet damit, dass Alita als Championin aus dem Sport zurücktritt. Sie lebt zwei Jahre lang ein ruhiges, ziviles Leben, widmet sich der Musik und arbeitet als Bar-Sängerin, bevor neue Bedrohungen sie wieder zum Handeln zwingen.

Für Motorball nutzt Alita einen spezialisierten Cyborg-Körper, der für Geschwindigkeit und Flexibilität ausgelegt ist und dabei etwas von der rohen Kraft und schweren Bewaffnung ihres vorherigen Berserker-Körpers opfert. Dieser schlanke, oft lila gefärbte Rahmen trug die Nummer 99. Ihr primäres Waffensystem ist die Damaszener Klinge, die sie mit tödlicher Präzision führt und in der Lage ist, Gegner und ihre Waffen mühelos zu durchschneiden. Während diesem Körper die Plasmaemissionsfähigkeiten des Berserkers fehlen, ist er perfekt auf den hochgeschwindigkeitsnahen Nahkampf der Rennstrecke abgestimmt, was es ihr ermöglicht, unglaubliche akrobatische Kunststücke auszuführen und verheerende Schläge mit ihren Panzer-Kunst-Kampftechniken zu landen.