Naoko Kamikishiro ist eine Schülerin im dritten Jahr an der Shinyo Academy in der Stadt, in der die Ereignisse von Boogiepop und andere stattfinden. Sie ist eine fröhliche und aufgeweckte junge Frau mit einem freundlichen und zugänglichen Wesen, das andere beruhigt. Sie hat schulterlanges, welliges hellbraunes Haar und braune Augen und wird oft in der Standarduniform der Shinyo Academy gesehen. Trotz ihrer unbeschwerten Art ist sie dafür bekannt, häufig ein Lied mit dem Titel „Das Leben ist kurz“ zu summen oder zu singen, was auf eine nachdenklichere Seite ihrer Persönlichkeit hindeutet.

Naoko ist zutiefst mitfühlend und einfühlsam, immer bereit, anderen zu helfen und zu verstehen, wie sie sich fühlen. Diese angeborene Freundlichkeit wird zur treibenden Kraft ihrer Rolle in der Geschichte. Durch Zufall trifft sie auf ein Wesen namens Echoes, das auf der Straße zusammengebrochen ist. Echoes ist eine außerirdische Entität, die gesandt wurde, um die Menschheit zu bewerten, aber er erscheint als zerlumpter, sprachloser Mann. Bewegt von seiner Notlage, nimmt Naoko ihn auf und erfährt durch eine telepathische Verbindung, die zwischen ihnen entsteht, von seinem Zweck und der Bedrohung durch ein anderes Geschöpf namens Manticore. Ihre Fähigkeit, Mitgefühl für ein Wesen zu zeigen, das nicht durch normale Sprache kommunizieren kann, ist ein entscheidender Moment in der Erzählung; es wird angedeutet, dass ihre Freundlichkeit es Echoes letztendlich ermöglicht, den Wert der Menschheit zu erkennen und so die Menschheit vor dem Urteil zu retten.

Naoko ist eng befreundet mit Nagi Kirima, einem eher stoischen und entschlossenen Mädchen, das die seltsamen Vorkommnisse in der Stadt untersucht. Sie hat auch eine romantische Beziehung sowohl zu Shirou Tanaka als auch zu Akio Kimura und pflegt eine Bindung zu jedem von ihnen. Ihre Gespräche mit Akio offenbaren eine nachdenkliche und philosophische Seite, da sie ihn einmal fragte, ob er glaube, dass die menschliche Existenz gerechtfertigt sei, und ihm von ihrer Begegnung mit Echoes erzählte.

Naoko wird ein Opfer von Manticore, der sie tötet, als sie während einer Konfrontation versehentlich auf das Geschöpf stößt. Ihr Tod sendet Wellen durch das Leben derer, die sie kannten: Akio Kimura erhält einen Brief über ihren Tod und kehrt zurück, um zu ermitteln, Shirou Tanaka sucht nach Antworten über ihr Verschwinden, und Nagi Kirima ist tief betroffen vom Verlust ihrer Freundin. Selbst nach ihrem Tod beeinflusst Naoko weiterhin die Ereignisse. In einem Bericht erscheint Naoko während eines späteren Endkampfes zwischen Nagi Kirima und der Entität namens Walpurgis ein letztes Mal vor Nagi, um letzte Worte zu teilen, die den Ausgang des Konflikts mitbestimmen.

Ihre bemerkenswerten Fähigkeiten sind nicht kampforientiert, sondern eher empathischer und telepathischer Natur. Sie besitzt eine Gabe, andere auf einer tiefen Ebene zu verstehen, sogar Wesen ohne Sprache, und sie teilt eine telepathische Verbindung mit Echoes. Diese Gabe, kombiniert mit ihrem sanften Herzen und ihrer Offenheit, ermöglicht es ihr, eine Verbindung zu einem Wesen von jenseits der Erde herzustellen und eine Schlüsselfigur bei der Bewahrung der Zukunft der Menschheit zu werden.