Folge 12 von Ayaka dient als Staffelfinale und beginnt damit, dass Yukito in die Ley-Energie taucht, um Jingi zu retten. Im Inneren der Ley-Energie trifft er auf seinen Vater, Yanagi Makoto, der den Feuerdrachen in Schach gehalten hat. Yanagi Makoto erklärt, dass er Yukito weggeschickt hat, um seine Verbindung zum Feuerdrachen zu schwächen und ihn darauf vorzubereiten, eine Schutzgottheit der Insel zu werden.
Yukito erfährt von seinem Vater, dass Jingi sich an ein Bild klammert, das Yanagi Makoto als Orientierungspunkt in der Ley-Energie hinterlassen hat. Sie machen sich auf den Weg, um ihn zu finden, und Yanagi Makoto lehrt Yukito das Konzept der Ley-Meisterschaft, das es ihm ermöglicht, durch die Ley-Energie zu navigieren. Schließlich finden sie Jingi, der immer noch sehr am Leben hängt und auf die Insel zurückkehren möchte.
Währenddessen taucht auf der Insel eine neue Welle von Ara-Mitama auf. Aka, Haruaki und die anderen wehren sie ab und besprechen ihre Sorgen um Yukitos Sicherheit in der Ley-Energie. Sie spüren eine Verbindung zu Yukito und Jingi und versuchen, sie zurückzuholen.
Yukito und Jingi werden durch diese Verbindung zurück auf die Insel geführt. Bevor sie die Ley-Energie verlassen, sagt Yanagi Makoto zu Yukito, dass er auf seine Brüder und die Insel aufpassen soll. Yukito und Jingi kehren erfolgreich zurück, sehr zur Erleichterung ihrer Freunde und Familie.
Die Episode endet mit einer Montage, die die Charaktere bei ihren täglichen Verrichtungen zeigt. Yukito trägt eine Schuluniform, was darauf hindeutet, dass er beschlossen hat, zur Schule zu gehen. Er schließt sich seinen Freunden an, und sie gehen zur Aufnahmezeremonie, die den Beginn eines neuen Kapitels in ihrem Leben markiert.
Die Folge schließt die Serie ab, indem sie zeigt, dass das Leben auf der Insel Ayaka, gefüllt mit verschiedenen Erfahrungen, wie gewohnt weitergeht.