Die Episode beginnt damit, dass eine Frau, Nakajima Takako, das Detektivbüro Mori aufsucht, um ihren Mann, Nakajima Hiroshi, als vermisst zu melden. Obwohl sie sich an die Polizei gewandt hatte, wurde sie nicht ernst genommen, so dass sie die Hilfe des Detektivs Mori Kogoro in Anspruch nahm. Hiroshi, ein 36-jähriger Angestellter, wird seit drei Tagen vermisst, und Takako macht sich große Sorgen um ihn.
Mori erklärt sich bereit, den Fall zu übernehmen, und beginnt mit den Ermittlungen, indem er einige von Hiroshi zurückgelassene Gegenstände untersucht, darunter Visitenkarten, Fotos, einen Laptop und eine von seiner Frau geschriebene Notiz. Sie finden heraus, dass Hiroshi seinen Job vor sechs Monaten gekündigt hatte, was seiner Frau nicht bekannt war, da sie seine Bewegungen per GPS verfolgte und glaubte, er würde immer noch ins Büro gehen. Takako ist eine kontrollierende Ehefrau, die Hiroshi nur 2.000 Yen pro Monat für Ausgaben zur Verfügung stellt und von ihm verlangt, dass er regelmäßig seinen Aufenthaltsort meldet.
Die Ermittlungen führen sie zu einem Tauchgeschäft, wo sie erfahren, dass Hiroshi früher dort arbeitete und eine Leidenschaft für Haie hatte. Aus finanziellen Gründen hatte er das Geschäft jedoch seit vier Jahren nicht mehr besucht. Sie sprechen auch mit Hiroshis Bruder Ryu, der aufgrund von Takakos kontrollierendem Wesen nicht über sein Verschwinden überrascht ist.
Mori und Conan kommen zu dem Schluss, dass Hiroshi seine Zeit im Keller seines ehemaligen Bürogebäudes verbracht hat, wo er ein geheimes Aquarium eingerichtet hat, nachdem er im Lotto eine Milliarde Yen gewonnen hatte. Leider entdecken sie Hiroshis Leiche in dem Aquarium. Sie verdächtigen Nishimura Masa, einen ehemaligen Mitarbeiter und Freund von Hiroshi, als Mörder. Nishimura streitet die Tat zunächst ab, doch Beweise wie ein heruntergefallener Ohrring und Aufnahmen der Überwachungskamera belegen seine Schuld. Nishimura hatte Hiroshi beim Bau des Aquariums geholfen, ihn aber nach einem Streit über die Aufteilung des Lottogewinns umgebracht.
Am Ende stellt sich heraus, dass Hiroshi seinen gesamten Lotteriegewinn für den Bau des geheimen Aquariums ausgegeben und nichts für seine Frau übrig gelassen hat. Die Folge endet damit, dass Mori und Conan darüber diskutieren, was sie essen wollen, und es wird eine Vorschau auf die nächste Folge, "Tsuburaya Mitsuhikos Detektivnotizen 2", gezeigt.