Angeführt von Kohaku und Suika stößt das Königreich der Wissenschaft im Epizentrum der Versteinerung auf eine unzählige Anzahl deaktivierter Petrificationsgeräte (Medusas). Die sofortige Untersuchung durch Senku und Dr. Xeno offenbart, dass der zentrale Diamant in jedem genutzten Gerät geschwärzt und damit wirkungslos ist, ähnlich einer entladenen Batterie. Während die Gruppe so viele Medusas wie möglich sichert, um sie zu studieren, treibt Senku gleichzeitig den Bau eines speziellen Schiffes voran. Dieses Tarnkappen-Schiff, dessen schräge Form und mit Medusa-Gehäusen verkleidete Oberfläche Radarwellen absorbieren soll, ist die einzige Hoffnung, der unaufhaltsamen Verfolgung durch Stanleys radargeführtes Kampfflugzeug zu entkommen.

Parallel dazu initiiert Senku von Brasilien aus ein zweites, ebenso kritisches Projekt im heimischen Corn City: die künstliche Herstellung neuer Diamanten, um die Medusas wiederzubeleben. Entgegen der Annahme, dass dies nur Spezialisten möglich sei, weist Senku das Team um Yuzuriha, Nikki und Magma an, die Diamanten mittels Hochtemperatur-Behandlung von Alkoholdampf mit Wolfram-Filamenten zu synthetisieren. Nach anfänglichen Rückschlägen gelingt ihnen der Durchbruch und sie produzieren funktionsfähige Diamanten. Diese Meisterleistung demonstriert, dass Wissenschaft nicht nur Genies vorbehalten ist. Mit den neuen Diamanten und dem fertigen Tarnschiff rüstet sich das Team für die letzte Etappe zur Quelle der Versteinerung, wissend, dass Stanley ihnen ständig auf den Fersen ist.