Jun Maeda wurde am 3. Januar 1975 in der Präfektur Mie, Japan, geboren und absolvierte die Chukyo University mit einem Abschluss in Psychologie. Bevor er als Autor Erfolg hatte, strebte er zunächst eine Karriere als Musik-Komponist für große Videospielunternehmen wie Capcom und Namco an, war damit jedoch nicht erfolgreich. Dies veranlasste ihn, sich auf das Schreiben von Szenarien für Erwachsenenspiele zu konzentrieren, und er arbeitete schließlich 1997 beim Unternehmen Scoop am Spiel Chaos Queen Ryōko. Anschließend wechselte er zur Marke Tactics, wo er an den Drehbüchern und Soundtracks für die Spiele Moon und One: Kagayaku Kisetsu e mitwirkte. Nach der positiven Aufnahme dieser Titel verließen Maeda und mehrere Kollegen Tactics, um gemeinsam die Visual-Novel-Marke Key unter dem Publisher Visual Arts zu gründen.

Bei Key wurde Maeda zur treibenden kreativen Kraft hinter einigen der gefeiertsten Visual Novels des Mediums. Ihm wird die Pionierarbeit am Nakige, dem sogenannten "Weinspiel", zugeschrieben, einem Genre, das darauf ausgelegt ist, den Spieler zutiefst zu rühren und zu Tränen zu bewegen. Zu seinen bemerkenswerten Autoren- und Komponistenbeteiligungen für Key gehören Kanon, Air, für das er den Großteil des Szenarios schrieb, und Clannad, zu dem er etwa 75 % der Texte beisteuerte. Weitere bedeutende Key-Titel, an denen er mitwirkte, sind Little Busters! und Tomoyo After: It's a Wonderful Life. Er schrieb auch den Manga Hibiki's Magic, der 2004 begann.

Zusätzlich zu seiner Arbeit an Visual Novels ist Maeda für die Schaffung origineller Anime-Serien in Zusammenarbeit mit dem Animationsstudio P.A. Works und Aniplex bekannt. Die erste davon war Angel Beats! im Jahr 2010, für die er als ursprünglicher Planer, Autor und Komponist fungierte. Es folgten Charlotte im Jahr 2015 und The Day I Became a God im Jahr 2020, wobei er für jede Serie dieselben Kernrollen übernahm. Seine späteren Arbeiten umfassen das Originalkonzept und die Musik für die Visual Novel Summer Pockets sowie das Szenario und die Musik für das Rollenspiel Heaven Burns Red, das 2022 veröffentlicht wurde.

Maeda komponiert persönlich einen Großteil der Musik und schreibt die Texte für seine Projekte, und seine musikalischen Beiträge gelten als Schlüsselkomponente seines Geschichtenerzählens. Er gründete 2011 sein eigenes Plattenlabel Flaming June. Mehrere wiederkehrende Themen ziehen sich durch seine Werke. Ein häufiges Element ist der magische Realismus, bei dem fantastische oder übernatürliche Elemente in ansonsten normale Settings eingeführt werden, wie in Air und Clannad zu sehen. Seine Geschichten erforschen häufig die familiären Bindungen, insbesondere mütterliche Beziehungen, und vermischen oft Komödie mit Tragik, um die emotionale Wirkung dramatischer Momente zu steigern. Er ist auch für seine persönliche Liebe zum Baseball bekannt, die er in viele seiner Erzählungen einfließen lässt. Sein bedeutender Einfluss half, das Medium Visual Novel zu prägen und inspirierte eine Welle erfolgreicher Anime-Adaptionen, die dem Genre Mainstream-Aufmerksamkeit brachten. Im Jahr 2016 gab Maeda bekannt, dass er an dilatativer Kardiomyopathie, einer schweren Herzerkrankung, leidet. Nach der gemischten Aufnahme von The Day I Became a God erklärte er seine Absicht, sich vom Schreiben von Geschichten für Anime-Projekte zurückzuziehen.