Wakako Masuda ist eine Originalautorin, die vor allem für ihre Zusammenarbeit mit ihrem früheren Ehemann Ryuji Masuda bekannt ist, insbesondere im Bereich von 3D-CGI-Anime und Manga. Das Paar ist am bekanntesten für die Schaffung der Kult-Animeserie Popee the Performer.

Masudas Karriere ist durch ihre Partnerschaft mit Ryuji Masuda geprägt. Ihr erstes bekanntes gemeinsames Projekt war ein kurzer Animationsfilm mit dem Titel Drive Car. Danach entwickelten und präsentierten sie einen kurzen Pilotfilm dem japanischen Satellitenfernsehsender Kids Station, was zur Produktion von Popee the Performer führte. Die Serie wurde von 2000 bis 2003 ausgestrahlt und von einem sehr kleinen Team produziert, das aus Ryuji Masuda, Wakako Masuda und einem angestellten 3D-Animator bestand.

Während Ryuji Masuda als alleiniger Schöpfer des Popee the Performer-Anime genannt wird, spielte Wakako Masuda eine wesentliche Rolle bei dessen Produktion und der Erweiterung in andere Medien. Sie war eine von nur drei Personen, die an der Serie arbeiteten, und trug neben ihrem Ehemann und einem 3D-Animator zu deren Entstehung bei. Ihr bedeutendster Solo-Beitrag zum Franchise ist die Popee the Performer-Manga-Anthologie, die sie illustrierte. Dieser Manga wurde erstmals 2002 veröffentlicht und später 2015 neu aufgelegt.

Die künstlerische Identität, die mit den Arbeiten der Masudas verbunden ist, zeichnet sich durch surrealen Humor, schwarzen Humor und Slapstick-Gewalt aus, oft umgesetzt durch den Einsatz von 3D-Computergrafiken, die unter erheblichen Budget- und technischen Einschränkungen produziert wurden. Popee the Performer spielte beispielsweise in einer Wüste, um das Rendering zu vereinfachen, und enthielt keinen gesprochenen Dialog, um die Kosten für Synchronsprecher zu vermeiden. Dieser einfallsreiche Ansatz in der Animation wurde zu einem Markenzeichen ihres gemeinsamen Stils.

Neben Popee the Performer arbeitete das Duo an anderen Projekten zusammen. Sie arbeiteten gemeinsam an den Animeserien Mr. Stain on Junk Alley und Funny Pets und schufen auch eine Mangaserie mit dem Titel OH! Jesus!. Ein später geplantes Projekt war Phaeton & Me, das als Sequel-Manga mit einer erwachsenen Version der Popee-Figur gedacht war. Wakako Masuda sollte die Illustratorin für dieses Projekt sein, das schließlich nach der Auflösung ihrer Ehe abgesagt wurde.