Der Film spielt Mitte der 2050er Jahre oder in der "Zukunft". Wir lernen Takuto kennen, einen College-Jungen, der außergewöhnliche Arbeit in seinem wissenschaftlichen Bereich leistet. Das College, an dem er studiert, hat eine starke militärische Präsenz, wahrscheinlich aufgrund der vielen Forschungsgelder, die dort fließen. Aber aus einigen Hintergrundinformationen, die wir hier bekommen, geht hervor, dass die Dinge auf der Welt schlecht laufen und dass etwas Größeres im Gange ist.
Takuto hat es in letzter Zeit nicht leicht, da er nichts anderes tut, als sich mit seiner Freundin Maki zu streiten, da sie mehr und mehr Zeit mit dem Professor verbringt, unter dem sie arbeitet, als alles andere. Doch als sie plötzlich verschwindet und er mit Hinweisen zurückgelassen wird, um sie zu finden, landet er aufgrund seiner Fähigkeiten in der Metallurgie in einem Experiment des Professors.
Es stellt sich heraus, dass der Professor die Teile von außerirdischen Lebensformen in einen metallischen Körper eingebaut hat. Das Ziel ist es, dieses Objekt zum Leben zu erwecken und es dann zu kontrollieren. Innerhalb weniger Minuten, nachdem dieses neue Alien tatsächlich zum Leben erwacht ist, zerstört es das Labor und tötet den Professor und Maki vor den Augen von Takuto.
Einige Zeit später (nach diesem Ereignis) treffen wir Takuto wieder, der sich radikal verändert hat: Die Hälfte seiner Haare ist in silberne Stacheln gehüllt, er hat überall Narben und ein kraftvolles, selbstbewusstes Auftreten, das einfach nicht zu seinem früheren Aussehen passt. Ebenso hat er seinen Namen abgelegt, nennt sich jetzt Ryo Soma und ist ein zweiter Leutnant in der militärischen Kraft namens Funeral.This ist die Gruppe, die mit außerirdischen Invasionen auf der Erde beschäftigt.
Ryos Eintritt in Funeral dient nur einem Zweck, nämlich das Alien zu finden und zu eliminieren, bei dessen Wiederbelebung er geholfen hat und das amüsanterweise Frank heißt. Da das Alien nun unter der Kontrolle von Funeral ist, versucht er herauszufinden, wie er dieses Ziel am besten erreichen kann, während er sich mit dem größeren Problem weiterer Aliens auseinandersetzen muss, nur um herauszufinden, dass er Frank braucht, genauso wie das Kind, das Frank ins Herz geschlossen hat.