Ganze 10 Jahre nach Beginn der ursprünglichen Serie (bei uns liegt es ja noch nicht so lange zurück) ist der sympathische weiblich Cyborg Alita wieder da.

Alita ist erwachsen geworden. Und das nicht nur körperlich, sondern auch geistig. Nach einem sehr dramatischen Ende der ersten "Staffel", bei der das Mädchen von einer Bombe in tausend Teile gesprengt wurde, hat es der exzentrische Professor Desty Nova geschafft, aus Alita`s spärlichen Überresten einen ganz neuen Cyborg zu erschaffen.

Die neue Alita hat zwar den gleichen Charakter und die gleichen Erinnerungen wie die Alte, doch dank modernster Nanotechnologie und neusten Verfahren zur Entwicklung von künstlichen Menschen hat sie nun einen fast unzerstörbaren Körper, der zudem mit einigen Extras ausgestattet ist. Als sie mit ihrem erneuerten Bewusstsein erwacht, befindet sich der Kampfengel in Nova`s Labor.

Nach kurzen Instruktionen des Wissenschaftlers über ihre neuen Fähigkeiten, bleibt Alita jedoch nicht viel Zeit, sich daran zu gewöhnen. Über ihr in der Himmelsstadt Zalem ist die Hölle losgebrochen. Anscheinend hat Doktor Nova ein lange gehütetes Geheimnis gelüftet, das die Stadt verbarg. Und nun ist die Stadt alles andere mehr als ein friedlicher Ort.

Zeit für Alita, ihrer Bestimmung zu folgen: dem Kampf....