Die Geschichte zu „Onegai Twins“ entstand im Jahre 2002 und wurde erstmalig im darauffolgenden Jahr ausgestrahlt. In den insgesamt 12 Episoden wird die Beziehung dreier Teenager erzählt, die voneinander glauben verwand zu sein. Regie bei diesem Projekt führte Yasunori die, während für das musikalische Thema Feel, Soushi Hosoi und ZIZZ gewonnen werden konnten. Das Charakterdesign übernahm der Zeichner Hiroaki Gohda.
Einige Zeit, nachdem der Waise Maiku Kamishiro in das Haus gezogen ist, dass er aufgrund eines Fotos als sein altes Elternhaus identifiziert hat, taucht unerwartet Miina Miyafuji auf. Auch Miina hat ein Foto in der Hand. Auf diesem sind zwei Kinder vor Maikus Haus zu sehen. Beide vermuten, dass es sich bei ihnen um Geschwister handelt. So dauert es nicht lange und Miina zieht bei Maiku ein.
Noch am selben Tag des Einzugs, taucht Karen Onodera auf. Auch sie trägt ein Foto bei sich und vermutet verwandtschaftliche Verhältnisse. Während das gar muntere Trio nun gemeinsam in dem Haus lebt, versuchen sie untereinander zu klären in welcher Beziehung sie zu einander stehen.
Da die beiden Mädchen Maiku nicht auf der Tasche liegen möchte, suchen sich beide einen Job und fangen an zu arbeiten. Es dauert nicht lange und ein kleines Drama bahnt sich an – denn beide Mädchen scheinen sich in Maiku verliebt zu haben. Da die Schülerinnen eine tiefe Freundschaft verbindet, schliessen sie einen Pakt. Zunächst möchten sie klären, in wieweit sie mit Maiku verwandt sind. Diejenige, dessen Verwandtheitsgrad zu Maiku am geringsten ist, sei die Glückliche und darf versuchen Maikus Herz im Sturm zu erobern, während die andere sie dabei voller Tatendrang unterstützt.
Den Pakt vergessen die Mädchen nicht. Auch als sich der homosexuelle Junge Kosei Shimazaki mit einem Mal für den Jungen zu interessieren scheint, halten sie sich an ihr Versprechen.
Maki scheint von allen Seiten umworben zu sein. Auch Tasubaki Oribe interessiert sich neuerdings für ihn. Der Vizepräsidentin des Schülerrates scheint es völlig egal zu sein, dass sie sich in eine Reihe Verehrerinnen einzureihen hat. Die Situation scheint für Maiku mehr als verfahren zu sein. Doch auch der Versuch eines gemeinsamen Urlaubs scheint nicht zu fruchten. Einige Zeit später kommt die Wahrheit ans Licht: Kosei und Tsubaki waren früher einmal ein Paar als sie nach dem Tod ihres Bruders trauerte. Doch die Beziehung hielt nicht lange an und sie trennten sich bereits nach kurzer Zeit und ihm.
Kosei gelingt es nun aber Tsubakis Herz noch einmal zu erobern. Etwa zeitgleich findet Karen heraus, dass sie Maikus Schwester ist. So trifft sie sich mit ihm und mit ihrem neugewonnen Bruder einen schönen Nachmittag zu verleben. Da sie ihren Pakt nicht brechen möchte setzt das Mädchen alles daran, das nun Maiku und Miina endlich ein Paar werden. Mina und Karen bleiben auch weiterhin miteinander befreundet und so leben alle drei weiter zusammen in ihrem alten Elternhaus.
Maiku ist der Protagonist und eigentlich Leidtragende dieser Geschichte. Er ist recht ruhig und verschwiegen neigt jedoch dazu, hin und wieder ein wenig stur zu sein. Seine potenziellen Geschwister behandelt er ehr barsch und kommandiert sie oft herum.
Das Mädchen weist eine hyperaktive Persönlichkeit und wirkt auf ihre Mitmenschen daher hin und wieder anstrengend. Nach einiger Zeit entwickelt sie Gefühle für Maiku. Jedoch fürchtet sich das Mädchen diese auszuleben. Nach aussen wirkt das Mädchen stets unbekümmert und fröhlich, jedoch ahnt keiner um die Geheimnisse der Vergangenheit.
Karen ist von Natur aus recht schüchtern und sehr ängstlich. Sie neigt hin und wieder dazu, ohnmächtig zu werden. Das reservierte Mädchen spricht auch, ihr sehr nahestehenden Personen mit ihrem Titel Herr und Frau an. Wie Miina auch, entwickelt auch sie starke Gefühle für Maiku, die nicht schwesterlicher Natur sind. Jedoch lebt sie diese, aus den gleichen Gründen wie Miina auch nicht aus.
Die Geschichte weist die aussergewöhnliche Aufgabe sich mit den Schwierigkeiten des Erwachsenwerdens zu beschäftigen. Zentrale Personen sind hier drei Jugendliche, die sich allesamt zueinander hingezogen fühlen, von denen jedoch keiner so genau weiss, wie sie zueinander stehen.
Bei der Geschichte handelt es sich um eine Fortsetzung des Anime „Onegai Teacher“. Die Handlungen spielen allesamt am selben Ort. Und auch viele der Nebenrollen, wurden mit bereits bekannten Figuren besetzt. Leider greift auch bei dieser Fortsetzung das Phänomen, dass sie an die Klasse des Originals nicht heran kommt.