Eine Gruppe Wissenschaftler hat in einem Geheimlabor lange Zeit versucht das stärkste Pokémon aller Zeiten zu erschaffen. Da das legendäre Pokémon Mew als ehrfurchtgebietender Kämpfer mit unschlagbaren Fähigkeiten gilt, verwenden sie die DNA-Probe, eines im Amazonasgebiet gefundenen versteinerten Haares von Mew und verändern diese genetisch, um daraus Mewtu zu erschaffen. Sie ahnten jedoch nicht, über welche Kräfte ihre Schöpfung tatsächlich verfügt, denn Mewtu vernichtet das Laboratorium mitsamt den Wissenschaftlern. Verärgert über seine Schöpfer, die es zu einem Pokémon ähnlich Frankenstein´s Monster machten, schwört Mewtu Rache an der gesamten Welt. Zuerst wird es jedoch noch von Giovanni, dem Anführer von Team Rocket, hereingelegt, der ihm verspricht seine Fähigkeiten zu trainieren und es als gleichberechtigten Partner zu behandeln, es dann jedoch unterdrückt und für seine Zwecke einsetzt. Es kann jedoch erneut fliehen und kehrt auf seine Insel zurück, um seinen Plan, die Welt zu beherrschen, in die Tat umsetzen zu können
Unterdessen ruht sich Ash gerade mit seinen Freunden Misty und Rocko aus, als er von einem Trainer zu einem Kampf herausgefordert wird. Ash kann diesen mit seinen Pokémon jedoch problemlos schlagen. Doch dann taucht plötzlich ein Dragoran auf und bringt ihnen ein Hologram eines schönen Mädchens, dass eine mysteriöse Einladung zu einer Party im Palast von New Island ausspricht. Die Party wird von ihrem Meister, “dem weltbesten Pokémon Trainer” veranstaltet. Die drei Freunde nehmen die Einladung natürlich sofort an. Und auch Jessie und James von Team Rocket, die die Holobotschaft belauscht haben, nehmen sich vor an dieser Party teilzunehmen.
Kurz darauf haben sich alle eingeladenen Trainer an der Fährstation, die nach New Island übersetzt, versammelt und versuchen eine Überfahrt zu bekommen. Ein Orkan hat den Fährbetrieb jedoch lahmgelegt. Einige besonders unternehmungslustige Trainer lassen sich jedoch davon nicht abschrecken und benutzen ihre Pokémon um das gefährliche Gewässer zu überqueren. Zu diesen Trainern gehören auch Ash, Misty und Rocko, sowie Team Rocket. Nachdem sie das Schloss endlich erreicht haben, werden sie ersteinmal von Schwester Joy, dem Mädchen aus der Hologrammbotschaft, empfangen und zur Grossen Halle gebracht. Dort stellt sie die Trainer ihrem Gastgeber vor, Mewtu, ein Meister-Trainer und das mächtigste Pokémon der Welt, das von seinem Plan, die Welt mit einer speziell erschaffenen Rasse von Super-Pokémon zu beherrschen, erzählt.
Die Trainer können sich das natürlich nicht bieten lassen und wollen es bekämpfen, sind jedoch gegen Mewtu's Kräfte chancenlos. Stattdessen fertigt er verbesserte Klone der Pokémon an, mit denen er die Welt neu bevölkern will, nachdem er alles Leben auf ihr ausgelöscht hat. Er lässt diese Klone gegen die Originale antreten und verbucht einen Sieg nach dem anderen.
Doch dann ist es soweit, Mew taucht auf und es folgt ist der wohl grösste Pokémonkampf, den die Welt je gesehen hat, der entscheidende Kampf zwischen Mewtu und seinem “Vater”, dem seltenen und ebenfalls sehr mächtigen Pokémon Mew. Doch der Kampf wird nicht bis zum bitteren Ende ausgetragen, denn durch Ashs und Pikachus Freundschaft zueinander, die Ash sogar wiederbeleben konnte, wird Mewtu eines besseren belehrt und verschwindet mit seinen Pokémon-Klonen, um sich einen Platz zu suchen, wo sie ungestört und in Frieden leben können. Und auch Mew kehrt wieder an seinen geheimen Wohnort zurück.
Bevor Mewtu verschwindet, sorgt es noch dafür, dass alle Trainer und ihre Pokémon vergessen, was hier gerade passiert ist.
Titel: Pokémon - Der Film
engl. Titel: Pokémon: The first Movie
Genre: Zeichentrick-Abenteuer
Länge: 73 Minuten
Kinostart: 13. April 2000
Verleih: Warner Bros. Film GmbH
Regie: Kunihiko Yuyama
Drehbuch: John Touhey, Micheal Haigney, Norman J. Grossfeld, Takeshi Shudo
Kamera: Hisao Shirai
Produzent: Norman J. Grossfeld, Choji Yoshikawa, Tomoyuki Igarashi, Takemoto Mori
Schnitt: Toshio Henmi
Art Director: Katsuyoshi Kanemura
nach der Vorlage von: Satoshi Tajiri
Mewtu heisst im englischen Mewtwo, was soviel wie Mew 2 bedeutet und somit noch einmal darauf hinweisen soll, dass Mewtu sozusagen das Kind von Mew ist.
Wenn man den Film in den Ablauf der Serie einordnen will, so kann man mit Sicherheit sagen, dass die Explosion mit der anschliessenden Flucht von Mewtu, die Jessie und James in Folge 65 beobachten, der Flucht Mewtu's aus der Festung von Team Rocket und seiner anschliessenden Rückkehr auf die Insel, wo einstmals das Labor stand, in dem es geschaffen wurde, entspricht.
Auch Ausschnitte aus Garys Kampf mit Mewtu in der Arena von Vertania City aus Folge 63 sind im Film noch einmal zu sehen.
Vor dem eigentlichen Film, könnt Ihr noch den Kurzfilm “Pikachu's Ferien” sehen. Dieser Kurzfilm hat die Länge einer Trickfilmepisode und in ihm kommen nur Pokémon vor, allen voran natürlich Pikachu. In diesem Kurzfilm machen die Pokémon von Ash, Misty und Rocko einen Tag alleine Urlaub in einem Pokémonfreizeitpark und erleben dabei einige Abenteuer mit anderen Pokémon.
Für jeden Kinobesucher gab es eine von vier Promokarten (solange der Vorrat reichte). Diese sind Karten des Sammelkartenspieles, die es nur auf diese Weise gibt. Den Anfang machten Mewtu und Elektek und später gab es noch Pikachu und Dragoran.