"LayereD Stories 0" spielt in einer futuristischen Welt, in der virtuelle Realität und künstliche Intelligenz eine zentrale Rolle spielen. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von Protagonisten, die in einer digitalen Schicht, der sogenannten "Layer", leben und arbeiten. Diese Schicht ist ein komplexes Netzwerk, das die reale Welt mit einer virtuellen Umgebung verbindet, in der Menschen ihre Identitäten neu definieren und ihre Träume verwirklichen können.

Die Hauptfigur ist ein junger Programmierer namens Riku, der sich auf die Entwicklung von KI-Systemen spezialisiert hat. Riku wird in eine mysteriöse Verschwörung verwickelt, als er auf eine verborgene Schicht innerhalb der Layer stößt, die als "Layer 0" bezeichnet wird. Diese Schicht birgt gefährliche Geheimnisse und wird von mächtigen Organisationen kontrolliert, die ihre eigenen Interessen verfolgen. Riku schließt sich mit einer Gruppe von Gleichgesinnten zusammen, darunter die Hackerin Aya und der ehemalige Sicherheitsexperte Kaito, um die Wahrheit über Layer 0 aufzudecken und die Kontrolle über die digitale Welt zurückzuerlangen.

Im Verlauf der Geschichte werden die Charaktere mit moralischen Dilemmata konfrontiert, da sie herausfinden, dass die Grenzen zwischen Realität und Virtualität immer mehr verschwimmen. Die Handlung erforscht Themen wie Identität, Freiheit und die ethischen Implikationen von Technologie, während die Protagonisten gegen mächtige Gegner kämpfen und versuchen, die Kontrolle über ihre eigene Existenz zu behalten. Die Serie kombiniert actionreiche Szenen mit tiefgründigen philosophischen Fragen und bietet eine spannende Mischung aus Science-Fiction und Drama.