"Twins Hinahima" erzählt die Geschichte der Zwillinge Hina und Hima, die in einer kleinen, ländlichen Gemeinde aufwachsen. Die beiden Schwestern sind trotz ihrer äußerlichen Ähnlichkeit sehr unterschiedlich: Hina ist lebhaft, abenteuerlustig und oft impulsiv, während Hima ruhig, nachdenklich und eher zurückhaltend ist. Ihr Alltag ist geprägt von den einfachen Freuden des Landlebens, doch ihre Welt wird auf den Kopf gestellt, als sie eines Tages ein mysteriöses Artefakt in einem nahegelegenen Wald entdecken.

Das Artefakt erweist sich als Portal zu einer parallelen Welt, in der magische Kräfte und seltsame Kreaturen existieren. Die Zwillinge werden ungewollt in diese Welt hineingezogen und müssen sich mit den Herausforderungen auseinandersetzen, die diese fremde Umgebung mit sich bringt. Dabei lernen sie, dass ihre unterschiedlichen Persönlichkeiten und Fähigkeiten entscheidend sind, um die Rätsel dieser Welt zu lösen und zurück nach Hause zu finden.

Auf ihrer Reise treffen sie auf eine Vielzahl von Charakteren, darunter den geheimnisvollen Wanderer Kaito, der ihnen als Mentor dient, und die rebellische Magierin Yuna, die sich ihnen zeitweise anschließt. Gemeinsam erkunden sie die verschiedenen Regionen der parallelen Welt, die jeweils von eigenen Regeln und Gefahren geprägt sind. Dabei stoßen sie auf Hinweise, die auf eine tiefere Verbindung zwischen ihrer eigenen Welt und dieser magischen Dimension hindeuten.

Die Handlung entwickelt sich um die Suche der Zwillinge nach einem Weg zurück in ihre Heimat, während sie gleichzeitig versuchen, die Geheimnisse des Artefakts und der parallelen Welt zu entschlüsseln. Im Laufe der Geschichte werden sie mit moralischen Dilemmata konfrontiert, die ihre Beziehung zueinander und ihre individuellen Stärken auf die Probe stellen. Die Serie verbindet Elemente des Abenteuers, der Fantasy und des Coming-of-Age-Genres, wobei die Charakterentwicklung der Zwillinge im Mittelpunkt steht.