"Kikkō no Quarter" erzählt die Geschichte einer Gruppe von Jugendlichen, die in einer postapokalyptischen Welt leben, in der die Menschheit durch eine mysteriöse Katastrophe stark dezimiert wurde. Die Überlebenden haben sich in kleinen Gemeinschaften organisiert, die um begrenzte Ressourcen kämpfen. Die Handlung konzentriert sich auf vier Protagonisten, die in einer abgelegenen Siedlung aufwachsen und sich mit den Herausforderungen ihrer Umgebung auseinandersetzen müssen. Jeder von ihnen besitzt einzigartige Fähigkeiten, die sie im Laufe der Serie entwickeln und nutzen, um ihre Gemeinschaft zu schützen.

Die Hauptfiguren sind Akira, ein technisch begabter Junge, der oft als Anführer der Gruppe fungiert; Hana, eine mutige und entschlossene Kämpferin mit einem starken Sinn für Gerechtigkeit; Ren, ein ruhiger und nachdenklicher Charakter, der über übernatürliche Kräfte verfügt; und Yumi, eine kluge und strategisch denkende junge Frau, die oft als Vermittlerin zwischen den anderen agiert. Zusammen bilden sie das "Quarter", eine Einheit, die sich gegen äußere Bedrohungen wie marodierende Banden und mysteriöse Kreaturen, die in der zerstörten Welt umherstreifen, zur Wehr setzt.

Die Handlung entfaltet sich, als die Gruppe auf eine geheimnisvolle Organisation stößt, die behauptet, die Welt wiederherstellen zu können. Diese Organisation bietet den Jugendlichen die Möglichkeit, an einem gefährlichen Experiment teilzunehmen, das die Macht hat, die zerstörte Welt zu reparieren. Die Entscheidung, sich auf dieses Abenteuer einzulassen, führt die Gruppe in eine Reihe von Konflikten, die ihre Loyalität, ihre Fähigkeiten und ihre Moral auf die Probe stellen. Dabei werden sie mit der Frage konfrontiert, ob der Preis für die Rettung der Welt zu hoch ist und ob sie bereit sind, die Konsequenzen zu tragen.

Die Serie verbindet Elemente von Action, Drama und Science-Fiction, wobei die Charakterentwicklung und die zwischenmenschlichen Beziehungen im Mittelpunkt stehen. Die Handlung ist geprägt von moralischen Dilemmata, die die Protagonisten dazu zwingen, ihre eigenen Überzeugungen und Ziele zu hinterfragen.