Chibi Godzilla, eine winzige und entzückende Version des Königs der Monster, kommt auf der Erde an und beginnt, im Zuhause von Satomi, einer gewöhnlichen Büroangestellten, zu leben. Die Serie begleitet ihr gemeinsames Alltagsleben in einer modernen japanischen Wohnung, wo Chibi Godzilla begeistert, aber unbeholfen menschliche Routinen meistert, während er davon träumt, eines Tages ein wahrer Monsterkönig zu werden.

Die Hauptfigur, Chibi Godzilla, ist eine kleine grüne Kreatur, die noch über einen schwachen Atombrennstrahl verfügt, den sie für alltägliche Aufgaben wie das Anzünden von Geburtstagskuchenkerzen oder das Toasten von Brot einsetzt. Seine menschliche Betreuerin Satomi bewältigt geduldig das von ihm verursachte Chaos, von verschüttetem Essen bis hin zu eingebildeten Verwüstungen am Arbeitsplatz. Nebenfiguren umfassen Chibi-Versionen klassischer Toho-Kaiju, die gelegentlich zu Besuch kommen: Chibi Mothra, Chibi Rodan und der dreiköpfige Chibi Ghidorah.

Die Handlung entfaltet sich in extrem kurzen Episoden von etwa dreißig Sekunden bis zu einer Minute Länge, wobei jede eine in sich geschlossene Szene darstellt. Bemerkenswerte Handlungsbögen umfassen Chibi Godzillas Training, um König der Monster zu werden, seine Kochversuche trotz begrenzter Fähigkeiten, seinen Wunsch, wie Rodan zu fliegen, und einen Ausflug zu einer heißen Quelle. Eine weitere Episode zeigt, wie Chibi Godzilla glaubt, ein Feind nähere sich, nur um festzustellen, dass es sich lediglich um die draußen aufgehängte Wäsche handelt. Die Serie endet mit einer Episode mit dem Titel Okaeri! Chibi Gojira, was auf Deutsch Willkommen zu Hause! Chibi Godzilla bedeutet.

Durchgehend enthält die Animation subtile Anspielungen für langjährige Godzilla-Fans, wie etwa Chibi Godzilla, der sich mit seinem Atombrennstrahl durch die Luft schießt – eine Anspielung auf Godzilla vs. Hedorah aus dem Jahr 1971. Satomi trägt auch T-Shirts mit den Aufschriften Oxygen und Destroyer, die auf die Oxygen-Destroyer-Waffe aus dem originalen Godzilla-Film von 1954 verweisen. Der Ton bleibt heiter und familienfreundlich und konzentriert sich auf sanften Humor und die einfachen Freuden einer unwahrscheinlichen Freundschaft zwischen einem Menschen und einem legendären Monster in Miniaturform.