A Tale of the Secret Saint folgt einer jungen Frau namens Fia Ruud, die das am wenigsten talentierte Mitglied einer Ritterfamilie ist, aber entschlossen bleibt, in deren Fußstapfen zu treten. Während eines einfachen Tests, bei dem sie einen kleinen Dämon besiegen soll, um ihren Wert zu beweisen, sieht sie sich stattdessen einem Drachen gegenüber. Die Begegnung erweist sich als tödlich, und als Fia am Rande des Todes steht, zieht ihr Leben vor ihren Augen vorbei, was die plötzliche Erinnerung an ein früheres Dasein auslöst. Sie erinnert sich an ihr früheres Leben als legendäre und überaus mächtige Große Heilige, die vor dreihundert Jahren einem Helden half, den Dämonenkönig zu besiegen. Dieses Leben endete jedoch in Schmerz und Verrat, da sie nach dem Verbrauch ihrer Kräfte verlassen und gefoltert wurde. Diese traumatische Erinnerung wird von einer ernsten Bedrohung durch den rechten Hand des Dämonenkönigs begleitet, der schwor, sie zu finden und zu töten, sollte sie jemals als Heilige wiedergeboren werden. Mit der wiedererweckten heiligen Magie ihres früheren Lebens sieht sich Fia einer unmöglichen Situation gegenüber. Ihre neue Kraft könnte sie zu der Ritterin machen, von der sie immer geträumt hat, aber sie zu enthüllen würde sie als Heilige entlarven und in tödliche Gefahr bringen. Aus Angst vor einer Wiederholung ihres früheren Schicksals schwört sie, ihre Identität zu verbergen und ein ruhiges Leben als gewöhnliche Ritterin zu führen – ein Entschluss, der ständig durch ihr mitfühlendes Wesen und die schiere Nützlichkeit ihrer Fähigkeiten auf die Probe gestellt wird.

Die Geschichte spielt in einer Fantasiewelt, in der die Menschheit am Rande der Auslöschung steht, was Heilige zu hoch verehrten und entscheidenden Figuren macht. Die Erzählung konzentriert sich auf Fias Doppelleben, als sie den Ritterbrigaden beitritt, in der Hoffnung, unterzutauchen. Wichtige Figuren in ihrem neuen Leben sind Zavilia, ein mächtiger schwarzer Drache, mit dem sie einen Vertrag schließt, nachdem sie ihn geheilt hat, und der oft die Gestalt eines kleinen, schwach aussehenden Monsters annimmt, um ihr Geheimnis zu wahren; Saviz Nav, der Hauptmann der Ritterbrigaden; und Cyril Sutherland, der Hauptmann der Ersten Ritterbrigade. Ein bedeutender Handlungsbogen zeigt Fia, wie sie einer Lernexpedition mit der Vierten Monsterbändiger-Brigade beitritt, wo ihre Kräfte fast aufgedeckt werden. Sie muss auch mit der ständigen Beobachtung ihrer Umgebung umgehen, die neugierig auf ihre Fähigkeiten und den kleinen Drachen an ihrer Seite wird. Während sie die Gefahren des Rittertums bewältigt, lastet das Trauma ihres früheren Lebens schwer auf ihr, insbesondere die Erinnerung daran, für ihre Kräfte getötet worden zu sein, was die zentrale Spannung zwischen ihrem Wunsch, anderen zu helfen, und ihrem verzweifelten Bedürfnis, verborgen zu bleiben, schafft.