Ein Junge namens Kazuki Tsukigase kommt auf die abgelegene Insel Tokishima, nachdem er die Stadt verlassen hat, um allen zu entfliehen, die ihn und das Geheimnis, das er mit sich trägt, kennen. Die Insel ist ein Ort üppiger Natur und beherbergt einen Ort, den die Einheimischen die Bucht der Verschwundenen nennen – eine Stelle, von der es heißt, dass dort Menschen spurlos verschwinden. An einem Tag im Frühsommer entdeckt Kazuki in ebendieser Bucht ein Mädchen, das bewusstlos zusammengebrochen ist.

Das Mädchen wird in die Inselklinik gebracht, wo es keine Angaben zu seiner Vergangenheit oder seiner Familie machen kann. Sie nennt ihren Namen als Nanao Akishika und gibt an, sechzehn Jahre alt zu sein, doch der einzige weitere Hinweis, den sie bietet, ist ein einziges geflüstertes Wort: 1974. Da sich niemand um sie kümmert, nimmt sie ein Einheimischer namens Takatsu auf, der sie zusammen mit Kazuki gerettet hat. Fasziniert von dem rätselhaften Mädchen beginnt Kazuki, Nanao nach der Schule zu besuchen. Während sie den Sommer miteinander verbringen, verringert sich langsam die Distanz zwischen ihnen, und ihr Alltag füllt sich mit neuen, unbekannten Gefühlen.

Ein Mitschüler von Kazuki, Mikiya Ozaki, wird ebenfalls Teil des Kreises von Menschen, die in das Geheimnis um Nanao hineingezogen werden. Doch gerade als sich eine Bindung zu entwickeln beginnt, offenbart Nanao Kazuki eine unerwartete Wahrheit, die sie beide zwingt, der Realität ins Auge zu sehen, dass sie sich niemals hätten treffen sollen. Ihre Reise erforscht komplexe Emotionen und verborgene Geheimnisse und führt auf eine bittersüße Zukunft nach einem einzigen, transformativen Sommer zusammen.