Vor langer Zeit fand im Land ein großer Krieg unter den Ninjas statt. Die vier überlebenden Clans – Koga, Iga, Fuma und Saika – bewahrten einen fragilen Frieden, indem jeder einen mächtigen Gegenstand namens Krypto-Schriftrolle besaß, der ein Machtgleichgewicht sicherte. In der Gegenwart ist die Ninja-Stadt Kouka (auch Koka genannt) zu einer gewöhnlichen Stadt geworden, in der die Menschen vergessen haben, dass Ninjas jemals existierten. Dieser Frieden wird zerstört, als eine in der Stadt aufbewahrte Krypto-Schriftrolle gestohlen wird, was einen Kampf aller gegen alle unter den Ninja-Clans entfacht, die nun um die Kontrolle über das Artefakt wetteifern.

Die Geschichte folgt Sakuya, einer jungen Ninja aus dem Koga-Clan, die lieber auffallen möchte, als sich im Schatten zu verstecken. Sie führt ein ruhiges, gewöhnliches Leben in Kouka mit ihren Freunden Nemu und Xiaolan, doch der Diebstahl der Krypto-Schriftrolle zwingt alle drei, ihre friedliche Routine aufzugeben. Indem sie ihre Fähigkeiten vereinen, werden sie in den eskalierenden Konflikt hineingezogen und müssen kämpfen, um die Schriftrolle zurückzuholen, bevor das Chaos völlig außer Kontrolle gerät.

Die Serie umfasst mehrere Staffeln, wobei die erste Staffel im Oktober 2023 startete, die zweite Staffel im Januar 2024 folgte und die dritte Staffel, mit dem Untertitel San no Maki, von Juli bis September 2025 ausgestrahlt wird. Jede Episode dauert etwa drei bis fünf Minuten und bietet eine temporeiche, kompakte Handlung, die Action und Comedy verbindet. Der Anime wird vom Studio Fanworks produziert, mit Akifumi Nonaka als Regisseur und Toru Hosokawa für das Drehbuch verantwortlich. Die Originalcharaktere basieren auf dem CryptoNinja-NFT-Projekt, das von Ikehaya mit Illustrationen von Rii2 erstellt wurde.