Achtzehn Monate nach der Gründung der Bibliotheksverteidigungsstreitkräfte hat der Kampf gegen das Medienverbesserungsgesetz einen kritischen Wendepunkt erreicht. In einem nahen Zukunftsjapan, in dem staatliche Zensur durch bewaffnete Verbesserungskommandos brutal durchgesetzt wird, die alles als schädlich eingestufte Material beschlagnahmen und zerstören, stehen die Bibliotheksverteidigungsstreitkräfte als letzte Verteidigungslinie der geistigen Freiheit. Die Geschichte folgt Iku Kasahara, nun vollwertiges Mitglied der Task Force, der Elitekampfeinheit der Kantō-Bibliotheksverteidigungsstreitkräfte. Sie dient weiterhin unter der strengen, aber hingebungsvollen Aufsicht ihres Vorgesetzten Atsushi Dojo, den sie heimlich bewundert und der sie vor Jahren dazu inspirierte, den Streitkräften beizutreten, als er ein zur Zensur bestimmtes Buch sicherstellte.

Der Einheit wird eine scheinbar einfache, aber höchst symbolträchtige Mission zugewiesen: die Bewachung einer öffentlichen Ausstellung auf einem Kunstfestival, die das Handbuch des Bibliotheksrechts präsentiert, das letzte verbliebene Exemplar eines Buches, das als Symbol der Meinungsfreiheit gilt. Der Schutz dieses unersetzlichen Artefakts sollte ein Punkt des Stolzes für die Task Force sein, doch die Mission entpuppt sich schnell als ausgeklügelte Falle. Der Architekt dieses Plans ist Satoshi Tezuka, der brillante, aber desillusionierte ältere Bruder von Ikus Kollegin und Rivalin Hikaru Tezuka. Satoshi glaubt, dass die ständige Pattsituation mit den Zensurkräften die Bibliotheksverteidigungsstreitkräfte obsolet gemacht hat, und zielt darauf ab, die Task Force vollständig zu zerstören, in der Überzeugung, dass ihre Beseitigung einer Gesellschaft, die er als moralisch verdreht ansieht, helfen wird, sich zu korrigieren.

Als die Verbesserungskommandos einen massiven und gut koordinierten Angriff auf die Ausstellung starten, befindet sich die Task Force in einem Kampf ums Überleben, zahlenmäßig unterlegen und belagert. Der Erzählbogen konzentriert sich auf den verzweifelten Überlebenskampf der Gruppe, das Buch zu schützen und Satoshis Plan aufzudecken. Inmitten der intensiven Action werden persönliche Beziehungen an einen Bruchpunkt gedrängt, insbesondere die unausgesprochene romantische Spannung zwischen Iku und Dojo, die ihre ultimative Bewährungsprobe erfährt, als sie gemeinsam tödlicher Gefahr gegenüberstehen. Der Film vertieft auch die inneren Konflikte innerhalb der Einheit, da sie die Wirksamkeit ihrer Sache in Frage stellen, wenn sie mit solch überwältigendem Widerstand und Verrat aus den eigenen Reihen konfrontiert werden.