Die Monsterinsel ist die Heimat von winzigen, Chibi-Versionen berühmter Kaiju, wo der junge und eifrige Chibi Godzilla, der verstrahlte dinosaurierartige Sohn des kolossalen Godzilla, davon träumt, groß zu werden, damit sein Vater ihn umarmen kann. Sein Alltag auf der Insel wird auf den Kopf gestellt, als ein amnesischer Roboter-Doppelgänger, Chibi Mechagodzilla, an Land gespült wird und zu seinem engsten Begleiter und besonnenen Gegenpart wird. Gemeinsam erkunden sie die Eigenheiten der Insel und treffen eine schräge Truppe weiterer Chibi-Monster: den dreiköpfigen Chibi Ghidorah, dessen Köpfe sich ständig streiten; die idolenhafte Chibi Mothra, die selbstbewusster ist, als sie zugibt; den narzisstischen Flieger Chibi Rodan; den mürrischen, verschmutzungsbesessenen Chibi Hedorah; das elegante Pflanzen-Kaiju Chibi Biollante; den sanftmütigen, aber leicht überforderten Chibi Anguirus; und viele andere. Jede kurze Episode (etwa zweieinhalb Minuten) entfaltet sich als manzai-artige Comedy-Skizze, die trockenen Humor mit liebevoller Parodie der Tropen des Godzilla-Franchises verbindet. Über mehrere Staffeln hinweg folgt die Serie den Missgeschicken dieser unwahrscheinlichen Gruppe, während sie kleinere Rivalitäten, Lernstunden über ihre riesigen Eltern, versehentliche Sachbeschädigungen und die alltäglichen Absurditäten des Lebens auf einer Insel voller Miniaturmonster meistern. Im Kern dreht sich der Handlungsbogen um Chibi Godzillas beharrliche, aber oft komisch gescheiterte Versuche, sich als zukünftiger König zu beweisen, seine sich vertiefende Freundschaft mit dem rationalen Chibi Mechagodzilla und den wiederkehrenden Gag, dass die zerstörerischen Instinkte der Monster mit der Notwendigkeit von Zusammenarbeit und dem Aufräumen ihres eigenen Schlamassels kollidieren.