Im Jahr 2050 hat die Technologie Fortschritte gemacht, die die Verschmelzung der realen und virtuellen Welt durch Meta Reality (MR) ermöglichen. Menschen können alle fünf Sinne nutzen, um nahtlos mit digitalen Daten zu interagieren, was zu einer Gesellschaft führt, in der Komfort und Bequemlichkeit selbstverständlich sind. Der Oberschüler Taiki leidet jedoch unter einem angeborenen MR-Fehler, der ihn daran hindert, die MR-Welt richtig wahrzunehmen, und ihn von genau dem System trennt, das den Alltag bestimmt. Sein Leben ändert sich, als er auf Lily trifft, ein hoch entwickeltes künstliches Intelligenz-Mädchen, das als reines MR-Wesen ohne physischen Körper existiert. Lily rettet Taiki vor einem Angriff der Kiramon, monströsen Wesen, die einst Menschen waren, und die beiden gehen eine ungewöhnliche Partnerschaft ein. Taikis ungewöhnlicher Zustand, der ihn benachteiligt erscheinen lässt, verschafft ihm tatsächlich einen Vorteil gegenüber den Kiramon, und gemeinsam mit Lily beginnen sie, die Wahrheit hinter diesen Kreaturen aufzudecken.

Taiki ist ein freundlicher, aber müder Junge, der aufgrund seiner gestörten Sicht oft in Schwierigkeiten gerät, dennoch ist er einfühlsam und akzeptiert andere. Lily ist direkt, egozentrisch und schonungslos ehrlich; sie verlor ihre Macht als höheres Wesen, nachdem sie versuchte, eine Verbindung zu Taiki herzustellen, was sie zwingt, bei ihm zu leben, während sie nach einem Weg sucht, sich zu erholen. Ihr Team wächst um Kurumi, Taikis energiegeladene Kindheitsfreundin, die sich zunächst von ihm entfernte, aber wieder dazustößt, nachdem sie vor einem korrupten MR-Haustier gerettet wurde, und Asato, einen zynischen und zurückgezogenen otaku MR-Spieler, der Lily bewundert und sein Zuhause als Operationsbasis anbietet. Gemeinsam bilden sie das Team Level Robotica.

Die Erzählung folgt ihren Kämpfen gegen die Kiramon, deren Ursprung im menschlichen Herzen und Geist liegt, und ihren Bemühungen, die wahre Natur von MR, die Quelle von Lilys Macht und zu verstehen, was es bedeutet, in einer Welt, in der Virtuelles und Reales verschwimmen, menschlich zu sein. Zu den großen Handlungsbögen gehören die Entdeckung der Verbindung der Kiramon zu verlorenen menschlichen Emotionen, der Kampf, normale Menschen vor MR-bezogenen Vorfällen zu schützen, und die allmähliche Enthüllung tieferer Verschwörungen rund um die MR-Technologie selbst. Die Geschichte ist eine nahe Zukunftssci-Fi-Actionserie, die in einem lebendig neu interpretierten Shibuya, Tokio, spielt und das Leben an der Oberschule mit hochriskanten Kämpfen und philosophischen Fragen über Identität, Verbindung und die Grenzen der Realität vermischt.