"Pikaia!!" ist eine Anime-Serie, die in einer futuristischen Welt spielt, in der die Menschheit mit der Entdeckung eines mysteriösen Organismus namens "Pikaia" konfrontiert wird. Dieser Organismus, der in den Tiefen des Ozeans gefunden wurde, besitzt die Fähigkeit, die DNA anderer Lebewesen zu manipulieren und sie in hybridähnliche Kreaturen zu verwandeln. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von Wissenschaftlern, die versuchen, das Geheimnis des Pikaia zu entschlüsseln, während gleichzeitig eine globale Krise ausbricht, als der Organismus außer Kontrolle gerät und eine Bedrohung für die gesamte Menschheit darstellt.

Die Hauptfigur der Serie ist Dr. Akira Tachibana, ein renommierter Genetiker, der das Forschungsteam leitet. Tachibana ist von der Natur des Pikaia fasziniert, aber auch besorgt über die potenziellen Gefahren, die es mit sich bringt. Unterstützt wird er von seiner Kollegin Dr. Yuki Nakamura, einer Molekularbiologin, die sich auf die Erforschung von DNA-Mutationen spezialisiert hat. Zusammen mit weiteren Teammitgliedern, darunter der junge Techniker Ryo Tanaka und die erfahrene Ozeanografin Dr. Haruka Saito, versuchen sie, die Ausbreitung des Pikaia zu stoppen und eine Lösung zu finden, um die bereits infizierten Lebewesen zu heilen.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass das Pikaia nicht nur eine biologische Bedrohung ist, sondern auch eine tiefgreifende philosophische und ethische Debatte über die Grenzen der Wissenschaft und die Verantwortung des Menschen gegenüber der Natur auslöst. Die Charaktere müssen sich mit moralischen Dilemmata auseinandersetzen, insbesondere als sie herausfinden, dass das Pikaia möglicherweise eine intelligente Lebensform ist, die auf ihre eigene Weise kommuniziert und reagiert.

Die Handlung entwickelt sich zu einem Wettlauf gegen die Zeit, als das Pikaia beginnt, sich an Land auszubreiten und ganze Ökosysteme zu destabilisieren. Gleichzeitig gibt es politische und militärische Interessen, die versuchen, den Organismus als Waffe zu nutzen, was die Situation weiter verschärft. Die Serie verbindet wissenschaftliche Forschung, Action und emotionale Momente, während die Charaktere versuchen, eine Lösung zu finden, die sowohl die Menschheit als auch das Pikaia retten könnte.