"Holy Knight Light" erzählt die Geschichte von Mizelda, einer jungen Frau, die in einer von Dämonen bedrohten Welt lebt. Mizelda ist die Tochter eines Priesters und wächst in einem Dorf auf, das von einer mysteriösen Bedrohung heimgesucht wird. Als sie eines Tages von einem Dämon angegriffen wird, wird sie von einem geheimnisvollen Krieger namens Shinta gerettet. Shinta ist ein sogenannter "Holy Knight", ein Kämpfer, der über übernatürliche Kräfte verfügt und gegen die Dämonen kämpft. Mizelda erfährt, dass sie selbst eine besondere Rolle in diesem Konflikt spielt, da sie die letzte Nachfahrin einer uralten Blutlinie ist, die die Macht besitzt, die Dämonen zu besiegen.

Die Handlung entwickelt sich, als Mizelda und Shinta sich auf eine Reise begeben, um die Quelle der dämonischen Bedrohung zu finden und zu vernichten. Dabei treffen sie auf verschiedene Verbündete und Gegner, darunter andere Holy Knights, die ihre eigenen Motive und Ziele verfolgen. Mizelda muss nicht nur lernen, mit ihrer neu entdeckten Macht umzugehen, sondern sich auch mit den moralischen und emotionalen Herausforderungen auseinandersetzen, die mit ihrer Rolle verbunden sind. Shinta, der zunächst distanziert und geheimnisvoll wirkt, enthüllt nach und nach seine eigene Vergangenheit und die Gründe für seinen Kampf gegen die Dämonen.

Im Laufe der Geschichte werden die Beziehungen zwischen den Charakteren vertieft, und es wird deutlich, dass der Konflikt zwischen den Menschen und den Dämonen komplexer ist, als es zunächst scheint. Die Handlung wird durch eine Mischung aus Action, Drama und übernatürlichen Elementen vorangetrieben, wobei die Charakterentwicklung und die zwischenmenschlichen Beziehungen im Mittelpunkt stehen. Die Serie thematisiert auch Fragen von Schuld, Verantwortung und der Suche nach Identität in einer von Chaos und Zerstörung geprägten Welt.