Die OVA "Kekkai" erzählt eine düstere und mysteriöse Geschichte, die in einer von übernatürlichen Kräften geprägten Welt spielt. Im Zentrum der Handlung steht ein junger Mann namens Shou, der in einer abgeschiedenen Region lebt und von einer rätselhaften Krankheit geplagt wird. Diese Krankheit verursacht, dass sein Körper langsam versteinert, und er sucht verzweifelt nach einem Heilmittel. Shous Leben ändert sich schlagartig, als er auf eine Gruppe von Jägern trifft, die sogenannten "Kekkai", die sich auf die Jagd nach gefährlichen Kreaturen spezialisiert haben.

Die Kekkai sind mit besonderen Fähigkeiten ausgestattet, die es ihnen ermöglichen, gegen übernatürliche Wesen zu kämpfen. Shou schließt sich ihnen an, in der Hoffnung, dass sie ihm helfen können, seine Krankheit zu heilen. Während der Reise mit den Kekkai wird Shou mit der brutalen Realität ihrer Welt konfrontiert, in der Menschen und Monster in einem ständigen Kampf ums Überleben stehen. Die Gruppe trifft auf verschiedene Gegner, darunter mächtige Dämonen und andere übernatürliche Wesen, die ihre Fähigkeiten und ihren Zusammenhalt auf die Probe stellen.

Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass Shous Krankheit eng mit den übernatürlichen Kräften der Welt verbunden ist. Es gibt Hinweise darauf, dass seine Versteinerung möglicherweise das Ergebnis eines Fluchs oder einer Verbindung zu einer alten, vergessenen Macht ist. Die Kekkai entdecken zudem, dass ihre Missionen und die Bedrohungen, denen sie gegenüberstehen, tiefer verwurzelt sind als anfangs angenommen. Die Grenzen zwischen Gut und Böse verschwimmen, und die Charaktere müssen sich mit ihren eigenen inneren Konflikten und moralischen Dilemmata auseinandersetzen.

Die OVA endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen lässt. Shous Schicksal bleibt ungewiss, und die Kekkai stehen vor neuen Herausforderungen, die ihre Welt weiterhin in Gefahr bringen. Die Handlung kombiniert Action, Mystery und düstere Fantasy-Elemente, während sie die Beziehungen zwischen den Charakteren und ihre individuellen Motivationen erkundet.