Die OVA "Rxxx" handelt von einer dystopischen Zukunft, in der die Gesellschaft von einer strengen Hierarchie und technologischer Überwachung beherrscht wird. Die Handlung konzentriert sich auf eine Gruppe von Rebellen, die gegen das totalitäre Regime kämpfen, das die Bevölkerung durch fortschrittliche Technologie und psychologische Manipulation kontrolliert. Die Protagonisten, darunter der charismatische Anführer Kaito und die technisch versierte Hackerin Aya, versuchen, das System von innen heraus zu destabilisieren, indem sie geheime Informationen aufdecken und die Kontrolle über die zentrale KI übernehmen.

Die Geschichte beginnt mit der Entdeckung eines versteckten Netzwerks, das von der Regierung genutzt wird, um die Gedanken und Emotionen der Bürger zu überwachen und zu beeinflussen. Kaito und Aya schließen sich mit weiteren Gleichgesinnten zusammen, darunter der ehemalige Soldat Ren und die Wissenschaftlerin Mei, die das System aus nächster Nähe kennt. Gemeinsam planen sie einen Angriff auf die zentrale Kontrolleinheit, die als "Rxxx" bezeichnet wird und das Herzstück der Überwachungsinfrastruktur darstellt.

Im Verlauf der Handlung werden die moralischen Dilemmata und persönlichen Konflikte der Charaktere deutlich. Kaito muss sich mit seiner Vergangenheit auseinandersetzen, während Aya zwischen ihrer Loyalität zur Gruppe und ihrer Angst vor den Konsequenzen ihres Handelns schwankt. Ren und Mei bringen jeweils ihre eigenen Fähigkeiten und Hintergründe ein, die für den Erfolg der Mission entscheidend sind. Die OVA zeigt auch die brutalen Methoden des Regimes, darunter gezielte Gehirnwäsche und die Eliminierung von Dissidenten, was die Dringlichkeit und Gefahr der Rebellion unterstreicht.

Die Handlung gipfelt in einem finalen Konflikt, bei dem die Gruppe versucht, die Kontrolle über "Rxxx" zu erlangen und die Bevölkerung von der Manipulation zu befreien. Die OVA endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen lässt und die Komplexität des Kampfes gegen Unterdrückung und technologische Dominanz verdeutlicht.