Kotaro Yanagisawa, der zunächst unter dem Pseudonym Shiro agierte, ist ein zentraler Antagonist, dessen Forschung die Grundlage der Serie bildet. Er war ein brillanter Biologe aus einer wohlhabenden Familie, der das angeschlagene Pharmaunternehmen Yukimura übernahm und eine arrangierte Beziehung mit dessen Erbin Aguri Yukimura einging. Als Wissenschaftler war er völlig amoralisch, einzig getrieben von seiner Arbeit, Antimaterie in einem lebenden Wirt zu erschaffen. Um dies zu erreichen, beschaffte er den inhaftierten Attentäter, bekannt als der Gott des Todes, als sein Versuchsobjekt und beauftragte Aguri, den Gefangenen zu beobachten, da er sie als völlig entbehrlich ansah. Das Experiment gelang, aber ein damit verbundener Test auf dem Mond verursachte eine katastrophale Explosion, die siebzig Prozent seiner Masse zerstörte. Aus Angst, sein Versuchsobjekt könnte das gleiche Schicksal erleiden, befahl Yanagisawa dessen Tötung. Aguri jedoch warnte den Gefangenen, was dessen Verwandlung in ein tentakelbewehrtes Wesen und seine gewaltsame Flucht auslöste. Yanagisawa überlebte die darauffolgende Explosion des Labors, verlor jedoch sein linkes Auge, was ihn zwang, auf eine mechanische Prothese zurückzugreifen. Aguri kam bei dem Vorfall ums Leben, und das Scheitern seines Projekts sowie ihr Tod verletzten seinen Stolz zutiefst.

Yanagisawa zeichnet sich durch Arroganz, völlige Ethiklosigkeit sowie eine manipulative und missbräuchliche Art aus. Er betrachtet jeden um ihn herum als wegwerfbares Werkzeug für seine eigenen Zwecke. Seine Hauptmotivation ist Rache an Koro-sensei, dem Wesen, das aus seinem Experiment entstand und dem er die Zerstörung seines Lebens und Vermächtnisses zuschreibt. In der Geschichte agiert er im Geheimen, um Angriffe auf Koro-sensei zu orchestrieren. Er findet einen tief verstörten Waisenjungen, Itona Horibe, und implantiert ihm Tentakel, um ihn als Waffe einzusetzen. Nachdem Itona wiederholt versagt, verwirft Yanagisawa ihn kaltblütig. Er hat auch eine Verbindung zu Aguris jüngerer Schwester Kaede Kayano, der er erlaubt, mit seiner Technologie in Koro-senseis Klasse einzudringen, wobei er sie als fähiges, aber dennoch entbehrliches Werkzeug betrachtet. Seine Beziehungen sind rein transaktional und von Manipulation geprägt.

Yanagisawas Entwicklung zeigt, wie er mit dem Scheitern seiner Pläne allmählich seine Zurückhaltung ablegt, wobei ihn seine Besessenheit zu verzweifelten Maßnahmen treibt. Zu seinen bemerkenswerten Fähigkeiten gehört sein geniales wissenschaftliches Fachwissen in der Antimaterie-Biologie, das es ihm ermöglichte, die Tentakel-Technologie zu erschaffen, die im Zentrum des Konflikts steht. Er nutzt auch fortschrittliche Ausrüstung wie einen Stimmmodulator und spezielle Kleidung aus Anti-Sensei-Fasern, um sich vor seinem Ziel zu schützen. In seiner letzten Konfrontation mutiert er seinen eigenen Körper durch Selbstexperimente in ein mächtiges tentakelbewehrtes Monster und erlangt immense physische Stärke. Seine unkontrollierbare Wut und mangelnde Disziplin erweisen sich jedoch letztlich als sein Verhängnis, da sein Stolz und seine Rachsucht zu einer Niederlage führen, die der von ihm ursprünglich verursachten Zerstörung gleicht.