Die Kommandantin, deren wahrer Name Iyo lautet, ist die Anführerin der Geheimorganisation DOGOO, die sich dem Schutz der Menschheit vor den außerirdischen Kreaturen, den sogenannten Evolutionären Invasionsobjekten, verschrieben hat. Ihre eigene Geschichte ist eng mit der Organisation verwoben, die sie heute befehligt. Ursprünglich stammte sie aus dem alten japanischen Königreich Yamatai, wo sie um das Jahr 248 n. Chr. als junge Königin die Nachfolge der berühmten Herrscherin Himiko antrat. Nach der Zerstörung ihres Königreichs wurde sie von einem mysteriösen außerirdischen Wesen angesprochen, das ihr Partner bei der Gründung von DOGOO werden sollte. Um ihre Mission über Jahrhunderte hinweg ausführen zu können, wurde sie in einen langfristigen Stasis-Zustand versetzt, aus dem sie periodisch erwachte, um die Sammlung von genetischem Material der einflussreichsten Persönlichkeiten der Geschichte, den sogenannten E-Genen, zu überwachen, mit denen zukünftige Krieger gestärkt werden sollten.

Die Kommandantin ist eine ältere Frau, die typischerweise ruhig, gefasst und entschlossen wirkt und sich mit dem Gewicht ihrer umfangreichen Erfahrung trägt. Ihr langes Leben, unterbrochen von Phasen der Ruhe und des Verlusts, hat ihre grundlegende Motivation geprägt. Sie wird von dem tiefen Wunsch angetrieben, die Erde zu beschützen, die sie nach dem Auf- und Niedergang von Zivilisationen als ihre einzig wahre Heimat betrachtet. Diese Motivation verhärtete sich nach einer persönlichen Tragödie im 19. Jahrhundert, als ihr Zuhause erneut zerstört wurde, und sie sich von einer friedlichen Frau in eine verwandelte, die bereit ist, alle notwendigen Maßnahmen zu ergreifen, um das Überleben des Planeten zu sichern. In ihrer fernen Vergangenheit zögerte sie zunächst, das gewalttätige und rücksichtslose E-Gen von Oda Nobunaga zu verwenden, was ihre eigenen persönlichen Erfahrungen mit den Schrecken des Krieges widerspiegelte. Doch ihr Pragmatismus und ihre Hingabe an ihr Ziel führten schließlich dazu, dass sie dessen Einsatz im Kampf gegen die Aliens genehmigte.

Innerhalb der Geschichte hat die Kommandantin die höchste Autorität in DOGOO inne, trifft kritische strategische Entscheidungen und führt die jüngeren E-Gen-Träger an. Sie ist keine Kämpferin an vorderster Front, sondern dient als Architektin der Mission und als emotionaler Anker für die Organisation, da sie deren Gründung und Zweck aus erster Hand miterlebt hat. Ihre bedeutendste Beziehung ist die zu ihrer Sekretärin und engen Begleiterin St. Germain, die seit Jahrhunderten an ihrer Seite ist und als Vertraute und Helferin bei ihrer Mission fungiert. Sie hat auch eine direkte Partnerschaft mit dem außerirdischen Wesen, das DOGOO gründete und ihr die Zukunft der Organisation anvertraute. Als Anführerin beaufsichtigt sie den Protagonisten Sio Ogura und andere E-Gen-Träger und genehmigt manchmal ihre unkonventionellen Strategien, selbst wenn diese aus Unerfahrenheit geboren sind.

Die Kommandantin zeigt keine direkten Kampffähigkeiten. Ihre Hauptstärke liegt in ihrer angesammelten Weisheit, ihrem unerschütterlichen Willen und ihrem umfassenden Wissen über das E-Gen-Projekt und den Feind, dem sie gegenüberstehen. Ihre Entwicklung im Laufe der Serie wird durch Rückblenden offenbart, die erklären, wie eine junge Königin aus dem alten Japan über Jahrtausende voller Verlust und Konflikte zu einer entschlossenen Kommandantin geformt wurde, wobei ein entscheidender Wandel stattfand, als sie ihr friedliches Leben aufgab, um alle notwendigen Mittel zur Verteidigung der Erde einzusetzen.