Izana Shinatose ist eine Bewohnerin des Generationenraumschiffs Sidonia und Pilotin der riesigen humanoiden Waffen, die als Gardes bekannt sind. Izana gehört einem gentechnisch veränderten dritten Geschlecht an, einer biologischen Klassifikation, die sich von männlich oder weiblich unterscheidet und im Laufe von Jahrhunderten der Raumfahrt unter den Menschen entstanden ist. Diese Biologie ermöglicht eine Umwandlung in einen männlichen oder weiblichen Körper basierend auf romantischer Anziehung zu einem Partner und erlaubt auch asexuelle Fortpflanzung durch Parthenogenese.

Hinsichtlich des Hintergrunds ist Izana ein Klon von Yure Shinatose, einer Wissenschaftlerin, die Mitglied des herrschenden unsterblichen Rates von Sidonia und Izzanas Großmutter ist. Izana lebt mit dieser Großmutter zusammen und pflegt regelmäßige Kommunikation mit ihr. Ursprünglich als Garde-Pilotenschülerin mit der Bezeichnung TS-291 dienend, wird Izana später zur Einheit 723 befördert.

Izana ist die erste Person auf der Oberfläche von Sidonia, die sich mit dem Protagonisten Nagate Tanikaze anfreundet, und behandelt ihn mit Freundlichkeit, als er Schwierigkeiten hat, sich an sein neues Leben anzupassen. Die Persönlichkeit ist zurückhaltend und einfühlsam, aber auch fähig, Eifersucht zu zeigen, insbesondere gegenüber anderen Frauen, die Interesse an Nagate zeigen, wie Shizuka Hoshijiro und das Hybridwesen Tsumugi Shiraui. Trotz dieser romantischen Rivalität pflegt Izana eine starke Freundschaft mit der Pilotenkollegin Yuhata Midorikawa und beschützt sie einmal im Kampf unter erheblichem persönlichem Risiko.

Als Izana mehr Zeit mit Nagate verbringt und romantische Gefühle für ihn entwickelt, beginnt der Körper eine unwillkürliche biologische Umwandlung in eine weibliche Form. Diese Transformation zeigt sich in körperlichen Veränderungen einschließlich Brustentwicklung und wird unverkennbar, als der Standard-Pilotenanzug nicht mehr auf den veränderten Körperbau passt. Das Geschlecht einer neutralen Person wie Izana wird durch das Geschlecht des Partners bestimmt, zu dem sie sich hingezogen fühlt.

Während eines Kampfes gegen die Gauna, insbesondere bei einer Begegnung mit einer Gauna, die Shizuka Hoshijiro imitiert, erleidet Izana kritische Verletzungen, die zum Verlust des rechten Arms und des linken Beins führen. Diese verlorenen Gliedmaßen werden durch fortschrittliche Prothesen ersetzt. Der Prothesenarm verfügt über ein Zehn-Finger-Design, das die Geschicklichkeit beim Piloten erhöht, mit der Fähigkeit, feine Aufgaben wie das Binden von Schleifen oder das Schälen von Früchten auszuführen. Ein neuronales Schnittstellensystem ist in die Garde-Einheit integriert und leitet Sensor- und Radarinformationen durch den Prothesenarm direkt ins Gehirn. Diese Modifikation bietet überlegene Langstreckenerkennungsfähigkeiten, die sogar die Systeme von Sidonia selbst übertreffen, was Izana außergewöhnlich gut für Aufklärungs- und Beobachtungsaufgaben im Kampf geeignet macht.

Izana geht eine bedeutende Freundschaft mit Tsumugi Shiraui, dem Menschen-Gauna-Hybriden, ein und hilft ihr, sich trotz Vorschriften gegen solche Handlungen verdeckt durch Sidonia zu bewegen. Nach der erfolgreichen Kolonisierung des Lem-Sternsystems durch Sidonia und der Niederlage des Großen Massenvereinigungsschiffs verlässt Izana etwa zehn Jahre später als eines der Besatzungsmitglieder an Bord einer reparierten Sidonia, um anderswo im Weltraum neue Planetenkolonien zu suchen.