Kotaro Fuma, dessen wahrer Name Isame Fuuma ist, ist eine Gestalt aus dem Fuma-Klan, einer Gruppe herrenloser Ninja, die durch eigene Traditionen verbunden sind. Er und sein älterer Zwillingsbruder Shirasu Kinjo sind die gemeinsamen zehnten Oberhäupter ihres Klans, die heimlich einer jahrhundertealten Pflicht zur Wiedererweckung des uralten Schlangendämons Orochi verschworen sind. Zehn Jahre vor den Ereignissen der Hauptgeschichte täuschten die Brüder das Massaker an ihrem eigenen Klan vor, um unterzutauchen. Während Shirasu in den Haushalt der Kumō eindrang, um über das Gefäß des Orochi zu wachen, nahm Kotaro den Namen Kotaro Fuma an und verschwand im Hochsicherheitsgefängnis Gokumonjo.

Innerhalb des Gefängnisses ist Kotaro eine leise bedrohliche Präsenz, oft mit einer Fuchsmasken gesehen. Er ist ein gerissener und geduldiger Intrigant, der eine Machtbasis aufbaut, indem er Opium an die Insassen schmuggelt und sie in eine Armee von Süchtigen verwandelt, die ihm treu ergeben sind. Seine zentrale Motivation ist seine unerschütterliche Pflicht gegenüber seinem Klan und die geplante Wiedererweckung des Orochi, eine Aufgabe, die er mit kalter Berechnung ausführt. Obwohl er auf die gleichen Ziele wie sein Bruder hinarbeitet, beteiligte er sich nicht an der Ermordung der Eltern der Kumo-Brüder, eine Tat, die er vollständig Shirasu zuschreibt.

Als Antagonist agiert Kotaro auf einer vom Hauptkonflikt getrennten Ebene; seine Kontrolle über die Gefängnisbevölkerung macht ihn zu einem gewaltigen Hindernis für die Kumo-Familie und die Orochi-Vernichtungseinheit. Seine Rolle unterstreicht die Tiefe der komplexen Verschwörung des Fuma-Klans. Seine größten Fähigkeiten liegen in seinem Intellekt, seinem Talent zur Manipulation und seiner strategischen Geduld – Eigenschaften, die es ihm ermöglichen, im Herzen des Gefängnissystems ein kriminelles Imperium aufzubauen.

Nach der Niederlage des Orochi wird Kotaro von den Kumo-Geschwistern in die Enge getrieben. Anstatt sich zu unterwerfen, wählt er den Sprung von einer Klippe in den scheinbaren Tod. Spätere Entwicklungen in der Geschichte zeigen, dass er den Sturz überlebt und zum wiederhergestellten Fuma-Klan zurückkehrt. Er trägt eine anhaltende und komplizierte Zuneigung zu den Brüdern in sich, gegen die er einst kämpfte.