Mikoto Urabe ist die Hauptheldin von Mysterious Girlfriend X, die als eine Transferstudentin an der Kazemidai High School vorgestellt wird, die von ihren Mitschülern sofort als seltsam wahrgenommen wird. Sie schläft oft während des Unterrichts und lacht unerwartet ohne ersichtlichen Grund, und ihr dicker Pony verdeckt ihre Augen, was ihr ein zurückgezogenes, unsoziales Aussehen verleiht. Trotz dieser kalten Fassade erlebt Urabe eine ganze Bandbreite an Emotionen, auch wenn sie diese auf ungewöhnliche Weise ausdrückt. Ihr markantestes Merkmal ist eine einzigartige physiologische Fähigkeit: Ihr Speichel trägt ihre Emotionen, körperlichen Empfindungen und sogar Erinnerungen und kann durch Verschlucken auf eine andere Person übertragen werden. Diese Fähigkeit bildet die Grundlage ihrer Beziehung zu Akira Tsubaki, der nach versehentlichem Kosten ihres Speichels körperlich süchtig nach ihrem Geifer wird; sie erklärt diesen Zustand als eine Form von Liebeskrankheit, und die beiden gehen eine romantische Beziehung ein, die durch einen täglichen Austausch von Speichel aufrechterhalten wird. Urabe ist dieser Bindung, die sie als eine heilige und mysteriöse Verbindung betrachtet, zutiefst ergeben, und sie legt strenge Regeln für deren Aufrechterhaltung fest. Sie ist auch äußerst geschickt im Umgang mit einer Schere, die sie in ihrer Unterwäsche versteckt hält und mit übernatürlicher Geschwindigkeit und Präzision einsetzt, sowohl für praktische als auch für symbolische Zwecke. Ihre Rolle in der Geschichte ist die der rätselhaften Freundin, deren unkonventionelle Art die Erzählung vorantreibt, und ihre Motivationen drehen sich darum, die einzigartige Bindung, die sie mit Tsubaki teilt, zu bewahren und zu vertiefen. Im Laufe der Serie wandelt sie sich von einer völligen Einzelgängerin, die Freundschaft aktiv ablehnt, zu einer offeneren Person und schließt eine enge Freundschaft mit Ayuko Oka, die von ihrem Geheimnis fasziniert ist. Ihre Entwicklung beinhaltet, dass sie lernt, Intimität und Vertrauen zu navigieren, während sie ihre unabhängige, geheimnisvolle Identität bewahrt. Zu den wichtigsten Beziehungen gehören ihr Freund Akira Tsubaki, mit dem sie die Speichelbindung teilt, die rohe Emotionen und Empfindungen überträgt; ihre Freundin Ayuko Oka, die zu einer Vertrauten und Brücke zum normalen sozialen Leben wird; und ihre gelegentliche Rivalin Aika Hayakawa, deren Anwesenheit Urabe dazu zwingt, ihr Engagement zu bekräftigen. Urabes bemerkenswerte Fähigkeiten sind die Speichelbindung, die es ihr erlaubt, Emotionen und körperliche Zustände zu übertragen, und ihr experter Umgang mit der Schere, den sie zum Schneiden von Gegenständen und gelegentlich als Drohung einsetzt. Ihr Hintergrund als Transferstudentin ohne bekannte Familie oder Vergangenheit wird absichtlich vage gehalten, was zu ihrer rätselhaften Natur beiträgt.