Makoto Kuonji ist einer der Hauptcharaktere im Anime Digimon Beatbreak. Er ist ein junger Junge mit heller Haut, blauen Augen und kurzem blonden Haar. Er trägt typischerweise ein weißes Hemd mit einer grünen Schleife am Kragen, eine beige karierte ärmellose Weste und braune Hosen. Sein Digimon-Partner ist Chiropmon.

Makoto wurde in einem Shangri-La-Ei in eine wohlhabende und einflussreiche Familie hineingeboren. Sein Leben änderte sich dramatisch, als er eine Partnerschaft mit Chiropmon einging; aufgrund dieser Bindung hielt seine Familie ihn für ungeeignet und verstieß ihn. Dieses Ereignis zwang ihn, seine privilegierte Erziehung hinter sich zu lassen und seinen eigenen Weg zu finden. Schließlich fand er ein neues Zuhause und eine neue Bestimmung als Mitglied des Cleaner-Teams Glowing Dawn.

Makoto fungiert als Hauptanalytiker des Teams und übernimmt Aufklärungs-, Berechnungs- und andere logistische Aufgaben, die seine Teamkollegen oft als mühsam empfinden. Er nimmt diese Rolle ernst und ist praktisch das Gehirn hinter vielen Strategien von Glowing Dawn. Seine Persönlichkeit ist ernst und zurückhaltend, und er kann anderen gegenüber direkt oder rücksichtslos mit seinen Worten sein. Trotz seiner äußeren Ernsthaftigkeit hat er spezifische persönliche Vorlieben: Er sieht sich gerne Horrorfilme an, besonders klassische Spannungsfilme, und mag heißes Wetter überhaupt nicht; er bevorzugt kühle, ruhige Umgebungen, in denen er klar denken kann.

Seine Motivationen wurzeln in dem Wunsch, nach der Ablehnung durch seine Familie Zugehörigkeit zu finden, und er entwickelt sich dahingehend, seine eigene Identität durch seine Arbeit und seine Bindungen zum Team zu definieren. Im Laufe der Geschichte wird seine tragische Vergangenheit tiefer erforscht, insbesondere in einer Episode, in der er gezwungen ist, sich seiner Vergangenheit zu stellen, als das Anwesen der Familie Kuonji von einem Loogarmon angegriffen wird. Dieser Vorfall führt zu einem Wiedersehen mit seinem jüngeren Zwillingsbruder Tsukasa Kuonji und offenbart eine komplexe Familiengeschichte.

Makotos Beziehung zu seinem Partner Chiropmon ist zentral für seine Rolle. Chiropmon hat eine otaku-ähnliche Persönlichkeit, ist intensiv neugierig auf alles, was ihm ins Auge fällt, und hat die Angewohnheit, vor sich hin zu murmeln. Obwohl Chiropmons Eigenarten anstrengend sein können, arbeiten die beiden effektiv zusammen. Während des Kampfes gibt Makoto Chiropmon Evolutionsbefehle, wie zum Beispiel „Los geht’s!“ und „Flieg!“ bei der Entwicklung zur Adult-Form (Night Chiropmon) und „Zu den höchsten Höhen!“ bei der Entwicklung zur Perfect-Form (Scourge Chiropmon). Sein analytischer Verstand und seine Fähigkeit, Informationen schnell zu verarbeiten, sind seine bemerkenswertesten Fähigkeiten, was ihn für die Planung und Durchführung von Missionen unverzichtbar macht.

Innerhalb von Glowing Dawn interagiert Makoto mit seinen Teamkollegen: der impulsiven Reina Sakuya, dem Anführer Kyo Sawashiro und dem Protagonisten Tomoro Tenma. Sein direkter und manchmal harter Kommunikationsstil steht im Kontrast zu den emotionaleren Mitgliedern der Gruppe, aber letztendlich betrachtet er das Team als eine neue Familie. Seine Entwicklung beinhaltet, anderen zu vertrauen und sich über seine Vergangenheit zu öffnen, wobei er sich von einem einsamen Analytiker zu einem integrierten Mitglied des Teams wandelt.