Shō Shishimaru dient als Arzt für die internationale Hilfsorganisation Earth Doctors, einer Tarnorganisation für die geheime Widerstandsgesellschaft Hermes’ Wings, die sich gegen das faschistische Godom-Imperium stellt. Sein humanitärer Antrieb, Leben zu retten, motiviert seine Arbeit. Aufgrund dieses Mitgefühls identifiziert der Anführer von Hermes’ Wings, der General, Shō als seinen potenziellen Nachfolger und den prophezeiten Retter, der dazu bestimmt ist, Godom zu besiegen.

Shō erlebt prophetische Visionen, in denen er die Ermordung des Generals und später einen Hinterhalt der Godom-Truppen in Tokio voraussieht. Während der Meditation in Izumo intensivieren sich diese Visionen und enthüllen apokalyptische Szenarien von Godoms Invasion und Begegnungen mit reptilischen Aliens. Indische buddhistische Mönche unter der Führung von Oberhaupt Dalani erklären ihn daraufhin zur Reinkarnation von Shakyamuni Buddha und zur neuesten Verkörperung des kosmischen Retters El Cantare, dessen vergangene Leben den alten Inka-König Rient Arle Croud einschließen. Dieses Schicksal kennzeichnet ihn als die vorhergesagte Figur, die dämonische Mächte besiegen und ein Zeitalter der Koexistenz von Mensch und Geist einleiten wird.

Nach der Ermordung des Generals durch den verräterischen Hermes’-Wings-Mitarbeiter Oberhaupt Urano übernimmt Shō die Führung des Widerstands. Um Blutvergießen während eines Versuchs zu verhindern, Godoms „Ultimative Zerstörungswaffe“ zu zerstören, ergibt er sich den Godom-Truppen. Kaiser Tathagata Killer lässt Shōs öffentliche Kreuzigung und Hinrichtung durch Erschießung weltweit im Fernsehen übertragen, um den Widerstandsgeist und den Glauben an den Retter zu brechen. Sein Tod löst weitverbreitete Verzweiflung aus, die erst überwunden wird, als Leika Chan – die sich als die venusianische Prinzessin Theta entpuppt – ihn durch göttliche Intervention nach Gebeten zum Gott der Erde wiederbelebt.

Wiederauferstanden erwacht Shō vollständig als der Retter, erlangt Erinnerungen an frühere Leben und führt das Symbol des Retters, ein Artefakt aus dem Titicacasee, als Stab der Autorität. Durch globales kollektives Gebet gestärkt, stellt er sich dem Dämon, der Tathagata Killer besitzt, und besiegt ihn. Nach dem Zusammenbruch des Godom-Imperiums und dem Erhalt fortschrittlicher Technologie von Theta, einschließlich eines bedeutsamen gemeinsamen Moments, wird Shō der neue General von Hermes’ Wings. Er begibt sich auf weltweite Reisen, um spirituelle Lehren zu verbreiten, Gesellschaften wiederaufzubauen und Tempel zu errichten, wie in den Schlusssequenzen des Films dargestellt.