Kyubey gehört zu den Incubators, einer emotionslosen Alienrasse, die die universelle Entropie bekämpft, indem sie emotionale Energie erntet. Diese Ernte erfolgt durch Verträge mit jungen Mädchen, die in magische Mädchen verwandelt werden und gegen Hexen kämpfen. Dabei wird die Seele des Mädchens in einen Soul Gem extrahiert, während ein widerstandsfähiger, aber seelenloser Körper zurückbleibt. Kyubey verschweigt bewusst entscheidende Details über diesen Prozess und das endgültige Schicksal der magischen Mädchen, die unweigerlich zu Hexen werden, sobald sie verzweifeln. Dieser Zyklus erzeugt immense Energie, um den Wärmetod des Universums hinauszuzögern.
Seine Gestalt ähnelt einer kleinen, weißen, katzenartigen Kreatur mit vier Ohren: zwei normalen Katzenohren und zwei langen, Quasten-ähnlichen Anhängseln, deren Spitzen von Rosa zu roten Punkten verlaufen. Goldene Ringe umgeben die Ohren, und ein eiförmiges, rotes Oval auf seinem Rücken dient als Behälter für Grief Seed-Fragmente. Kyubeys Gesicht bleibt weitgehend unbeweglich; es kommuniziert via Telepathie. Der Körper besitzt keine sichtbaren Organe und gibt plüschähnliche Geräusche von sich, wenn er berührt wird. Beschädigte Einheiten werden verzehrt und durch identische Kopien ersetzt, die das gesamte bisherige Wissen behalten.
Kyubey zielt auf Mädchen in extrem verletzlichen Situationen ab, etwa lebensbedrohlicher Gefahr oder emotionaler Not, und bietet ihnen einen Wunsch im Austausch für ihre Verwandlung in ein magisches Mädchen. Es priorisiert Effizienz über Transparenz und rechtfertigt Auslassungen als notwendig, um potenzielle Vertragspartnerinnen nicht zu traumatisieren. Da es Menschen als Nutztiere betrachtet, deren Leid im Vergleich zur Entropiereduzierung unbedeutend ist, nutzt Kyubey utilitaristische Logik und vergleicht menschliche Bedenken bezüglich der Seeleextraktion mit der Gleichgültigkeit von Menschen gegenüber Nutztieren. Obwohl es behauptet, keine böswilligen Absichten zu haben, manipuliert es Ereignisse, um Verzweiflung zu maximieren, einschließlich gezielter Todesfälle, um Madoka Kaname – ein Mädchen mit einzigartigem magischen Potenzial – zum Abschluss eines Vertrags zu drängen.
In mehreren Zeitlinien verfolgt Kyubey Madoka wegen ihres Potenzials, die übermächtige Hexe Kriemhild Gretchen zu werden, deren Energie die Entropie erheblich ausgleichen könnte. Homura Akemi, die durch wiederholte Zeitschleifen den Zyklus kennt, widersetzt sich Kyubey aktiv. In einer Zeitlinie verlässt Kyubey die Erde, nachdem das Energieziel erreicht ist, und überlässt die Menschheit den Hexen. Nach Madokas Wunsch, der alle Hexen über die Zeit hinweg auslöscht, wird die Realität neu geschrieben: Magische Mädchen verschwinden, bevor sie zu Hexen werden, und die Incubators passen sich an, um weniger effiziente Energie aus „Wraiths“ zu ernten. Kyubey behält keine Erinnerung an das vorherige System, untersucht aber Anomalien, die Homura meldet.
In *Rebellion* fängt Kyubey Homura in einer Barriere ein, um das „Gesetz der Zyklen“ (Madokas transzendente Form) zu isolieren und das Hexensystem wiederherzustellen. Es tarnt sich als stummes Maskottchen, während es das Experiment überwacht. Der Plan scheitert, als Homura einen Teil von Madokas Macht absorbiert und die Realität erneut umschreibt. Kyubey und seine Rasse werden in ihrer neuen Welt versklavt, um Flüche zu absorbieren, und sind sichtlich verfallen und psychisch gezeichnet.
In Spin-offs variiert Kyubeys Rolle. In *Kazumi Magica* nutzen die Pleiades Saints einen toten Incubator, um Jubey zu erschaffen, ein fehlerhaftes Gegenstück, das Soul Gems reinigt. Sie löschen magisch Kyubeys Präsenz aus den Erinnerungen anderer magischer Mädchen in Asunaro City. In *Wraith Arc* beobachtet Kyubey Homuras schwindende Erinnerungen und sichert sich ein Fragment ihres Zeitmanipulationsschilds, wodurch es seine Erinnerungen an das Universum vor Madoka bewahrt.
Fähigkeiten umfassen Telepathie, Teleportation, selektive Unsichtbarkeit (nur für magische Mädchen oder Kandidatinnen sichtbar), Wunscherfüllung gebunden an das Potenzial eines Mädchens, Soul Gem-Erschaffung, Sammlung von Grief-Energie und die Stimulation von Soul Gems, um physische Empfindungen wie Schmerz auszulösen. Die Spezies teilt ein kollektives Bewusstsein, und einzelne Einheiten sind funktional austauschbar.