Hayabusa, eine Ninja des Koga-Clans und Geschwister von Kojiro, erlebte, wie ihre Eltern anderthalb Jahre vor den Hauptereignissen von dem unsterblichen Cyborg Ginnai Doma getötet wurden. Obwohl sie von sofortiger Rache brannte, gehorchte Hayabusa widerwillig Kojis Befehl, während des Angriffs auf ihr Dorf den Rückzug zu priorisieren. Geprägt von Pragmatismus und emotionaler Zurückhaltung, kritisiert Hayabusa offen wahrgenommene Schwäche und weist den Protagonisten Shishimaru für die Trauer um einen gefallenen Kameraden zurecht. Dieser Konflikt erzeugt Reibung und veranlasst Shishimaru, ihren Clan als „lautstarke Frauen“ abzutun. Ihre Kampffähigkeiten erweisen sich als beeindruckend während koordinierter Angriffe auf Ginnai. Bei einer Infiltration schloss sie sich Kojis Team an, das Ginnai im Schlaf mit Giftpfeilen und Klingen überfiel. Obwohl Ginnai überlebte und einen Gegenangriff startete, griff Shishimaru ein, um Hayabusa vor einem tödlichen Schlag zu retten. Hayabusas Entwicklung wandelt sich von Distanziertheit zu einer tieferen Allianz. Nachdem der ältere Ninja Nagatoji sich opfert, um Ginnai aufzuhalten, vertraut er Hayabusa mit seinen letzten Worten Shishimarus Obhut an. Trotz früherer Konflikte zeigt sie verstärkte Kooperation und beteiligt sich später an einer taktischen Falle gegen Ginnai, bei der Sprengstoff und Felsstürze zum Einsatz kommen. In der Manga-Continuum agiert Hayabusa als Zeitreisende-Agentin des 23. Jahrhunderts. Sie reist mit den Verbündeten Burn Mano und Jimmy Rocca in die Sengoku-Zeit zurück, um Verzerrungen durch Nobunaga Odas anachronistische Technologie zu bekämpfen. Gefangen genommen und mentalen Verhören durch Nobunagas Truppen unterzogen, wird sie später befreit. Als sie die beinahe Vernichtung ihrer Verbündeten miterlebt, schließt sie sich Shishimaru und der außerirdischen „Black Lion“-Fraktion an, um interdimensionalen Bedrohungen entgegenzutreten. Nach Ginnais Niederlage in beiden Handlungssträngen verlässt Hayabusa mit Shishimaru und den Black Lion-Wesen die Szene und wechselt von persönlicher Rache zu einer umfassenderen Rolle als Beschützerin des Universums.