Alan Smithee agiert als Agent der Republik Gillanba (auch Jiranba genannt), einer fiktiven Nation, die unter militärischer Unterdrückung durch einen Nachbarn steht. Er verwendet "Alan Smithee" als Pseudonym, eine Anspielung auf den Platzhalternamen der Filmindustrie für verleugnete Projekte. Seine Hauptmission besteht darin, ein seltenes Mineralerz aus dem Königreich Vespania zu beschaffen, das einzigartige elektromagnetisch störende Eigenschaften besitzt, die für die Entwicklung fortschrittlicher Stealth-Militärtechnologie entscheidend sind. Smithee ist überzeugt, dass der Erwerb dieses Erzes unerlässlich ist, um das militärische Ungleichgewicht zu bekämpfen, das seine Heimat bedroht, und rechtfertigt dafür extreme Maßnahmen. Um dies zu erreichen, verbündet sich Smithee mit Luciano Carnevale (wirklicher Name Salvatore Lucania), einer Figur der italienischen Mafia, die die Konzerte des Popsängers Emilio Baretti als Deckmantel für illegale Aktivitäten nutzt. Smithee orchestriert einen komplexen Plan, um den "Cherry Sapphire" zu stehlen, einen Edelstein, der aus vespanischem Erz gefertigt wurde. Er zwingt Lupin III. zur Teilnahme, indem er Fujiko Mine entführt und sie mit einem Sprengkragen ausstattet, der ihr Leben bedroht, falls Lupin nicht kooperiert. Ein anfänglicher Diebstahl eines Diamanten durch Lupin, der sich als Kaito Kid verkleidet, dient als Test für den Hauptcoup. Smithees Plan gipfelt in einem hochriskanten Austausch auf dem Flughafen Haneda, wo Carnevale das gestohlene vespanische Erz gegen den Cherry Sapphire tauschen will. Ohne Smithees Wissen inszenieren Lupin und seine Verbündeten den Austausch als Täuschung. Jigen und Goemon infiltrieren die Szene, indem sie sich als Mittelsmänner – Kein Gejidasu und Eishin Wakagomo (ein Anagramm von Goemons Namen) – ausgeben, um das Treffen zu ermöglichen. Smithees schwer bewaffnete Leibwächter sorgen für Sicherheit, ausgestattet mit FN Five-seveN-Pistolen, Micro Tavor MTAR-21-Gewehren und Uzis. Als der Austausch gestört wird, nimmt Smithee Conan Edogawa als Geisel, um seine Flucht zu sichern. Auf dem Versuch, mit Carnevale und dem Erz per Frachtflugzeug zu fliehen, wird Smithee von Lupin und Conan verfolgt, die an Bord gelangen. Carnevale greift chaotisch ein und feuert eine tragbare M134-Minigun ab, die die Steuerung und die Hülle des Flugzeugs beschädigt. Dies führt dazu, dass Smithee tödliche Verletzungen erleidet und die Kabine eine explosive Dekompression erfährt, die Carnevale hinausschleudert. Smithee erliegt kurz darauf seinen Verletzungen, und das vespanische Erz geht verloren, als das Flugzeug ins Meer stürzt. Seine Handlungen sind von einem verbissenen, ernsten Auftreten geprägt, bei dem er seine Mission über alles andere stellt, einschließlich ethischer Grenzen.