Satoshi begibt sich mit Begleitern auf eine Reise, um die Ankunft des Millennium-Kometen zu beobachten, und taucht in die Festlichkeiten des Festes ein. Er bemerkt die schnelle nächtliche Errichtung der Festgelände und Vergnügungsparkattraktionen, was sein lebhaftes Interesse zeigt. Zusammen mit Max meldet er sich freiwillig für Butlers Zaubervorführung, wobei Satoshi in eine Kiste steigt, die für einen Entfesselungstrick mit Dusclops' Hyperstrahl gedacht ist, obwohl ein versteckter Transportmechanismus sie heimlich von der Bühne bringt. Als Team Rocket die Vorstellung unterbricht, um Pikachu zu stehlen, will Satoshi sie direkt konfrontieren, wird aber von Butler aufgehalten, der die Störung durch koordinierte Pokémon-Einsätze bewältigt. Satoshi und Max erhalten Applaus vom Publikum, das dies als Teil der Darbietung wahrnimmt. Nach der Vorstellung entdeckt Satoshi Jirachi mit seinen Freunden und sieht, wie Max den Kristall erhält, der das mythische Pokémon beherbergt. Er beobachtet, wie Jirachi unter dem Licht des Kometen erwacht und seinen ersten Wunscherfüllungsversuch unternimmt, der Snacks herbeiteleportiert und Chaos verursacht. Satoshi hilft, die chaotischen Folgen des Wunsches zu bereinigen. Als er erfährt, dass Butler Jirachis Kraft nutzen will, um Groudon wiederzuerwecken, unterstützt Satoshi die Flucht mit Jirachi in Richtung seines Heiligtums in Forina. Nachdem Butler sie verfolgt und Jirachi erneut ergreift, stellt sich Satoshi dem Zauberer entgegen, um das Experiment zu stoppen. Auf der Reise nach Forina steht Satoshi Max in dessen Kummer über Jirachis unvermeidlichen Abschied bei. Er erzählt von seiner Trennung von seiner früheren Begleiterin Misty und betont, dass tiefe Bindungen trotz räumlicher Distanz bestehen bleiben, um Max hinsichtlich seiner Verbindung zu Jirachi zu beruhigen. Im Höhepunkt bekämpft Satoshi das falsche Groudon, das durch Butlers korrumpiertes Experiment entstanden ist. Diese Kreatur saugt Lebensenergie aus Forina, gefährdet das Land und absorbiert Satoshis Verbündete. Satoshi koordiniert die Bemühungen mit Max, Butler und Jirachi, um der Bedrohung entgegenzutreten. Er beteiligt sich daran, die Kreatur abzulenken, sodass Jirachi die missbrauchte Energie zurückgewinnen und das falsche Groudon mit Unheilswunsch schließlich besiegen kann.