Takashi Natsume ist ein jugendlicher Junge, der die Fähigkeit seiner verstorbenen Großmutter Reiko geerbt hat, Yokai zu sehen. Als Waise verbrachte er eine unstete und isolierte Kindheit, in der er häufig zwischen Verwandten hin- und hergereicht wurde, die seine Begegnungen als Lügen oder Wahnvorstellungen abtaten. Dies führte zu Vernachlässigung, Mobbing und Ausgrenzung. Bestimmte Vorfälle, wie der Konflikt mit der eifersüchtigen Tochter Miyoko der Aoi-Familie oder der Baum-Yokai, der ihm eine mögliche Freundschaft kostete, vertieften seine Entfremdung und sein Misstrauen. Sein Kindheitswunsch war schlicht, allein zu leben, fernab von Menschen und Yokai.
Äußerlich hat Natsume staubblondes Haar (im Manga silbern) und goldbraune Augen mit schlitzförmigen Pupillen (im Manga grün). Er ist etwa 167 cm groß. Sein Aussehen wird oft als feminin beschrieben, was Vergleiche mit Reiko hervorruft und gelegentlich zu Spott führt, weshalb er bewusst männlichere Sprechweisen annimmt. Typischerweise trägt er seine Schuluniform und eine markante grüne Umhängetasche anstelle der standardmäßigen Schultasche.
Trotz seiner traumatischen Vergangenheit besitzt Natsume tiefe Güte und Empathie für Menschen und Yokai. Anfangs zurückhaltend und misstrauisch, öffnet er sich allmählich, nachdem er von dem unterstützenden Shigeru und Touko Fujiwara adoptiert wurde. Er bleibt beschützend gegenüber seinen Lieben und verheimlicht seine Yokai-Aktivitäten, um sie vor Sorgen oder Gefahr zu bewahren. Diese Fürsorge erstreckt sich auch auf Freunde wie Kaname Tanuma, der Yokai schwach wahrnehmen kann, obwohl Natsume schließlich lernt, deren Hilfe anzunehmen. Als Pazifist sucht er gewaltfreie Lösungen mit antagonistischen Yokai, verteidigt sich aber bei Bedarf körperlich. Seine spirituelle Kraft ermöglicht es ihm, Yokai mit Schlägen oder Tritten sofort außer Gefecht zu setzen, doch diese Fähigkeit wirkt nicht auf Menschen. Durch jahrelanges Flüchten vor Yokai besitzt er erhöhte Beweglichkeit, hat aber geringe Ausdauer und ist anfällig für Krankheiten.
Seine Beziehungen prägen seine Entwicklung. Die Fujiwaras bieten Stabilität: Shigerus ruhige Präsenz gibt emotionale Nahrung, während Touko als mütterlicher Rückhalt dient. Unter Gleichaltrigen helfen ihm Satoru Nishimura und Atsushi Kitamoto, sich sozial zu integrieren. Tanuma wird aufgrund ihrer gemeinsamen spirituellen Wahrnehmung zum Vertrauten. Seine Dynamik mit dem Yokai Madara, oft in Form einer Katze namens Nyanko-sensei, ist von ständigem Gezanke geprägt, zeigt aber gegenseitige Loyalität. Madara beschützt ihn im Austausch für das spätere Erbe des Buchs der Freunde, greift jedoch häufig in Natsumes Krisen ein, unabhängig davon.
Natsumes zentrale Aufgabe besteht darin, Namen aus dem Buch der Freunde – einem Verzeichnis von Yokai-Verträgen, die Reiko schloss – an ihre rechtmäßigen Besitzer zurückzugeben. Dies verbindet ihn mit dem Erbe seiner Großmutter und spiegelt seine Ablehnung wider, Yokai zu kontrollieren. Jeder zurückgegebene Name enthüllt Fragmente von Reikos Leben, vertieft sein Verständnis ihrer Einsamkeit und stärkt seinen Entschluss, einen anderen Weg zu gehen. Die Rückgabe der Namen symbolisiert die Wiederherstellung von Autonomie und Würde der Yokai, im Gegensatz zu Exorzisten wie dem Matoba-Clan, die Zwangsmethoden anwenden. Natsume widersetzt sich konsequent ihrem Druck, sich ihnen anzuschließen, und setzt sich für Koexistenz ein.
In offiziellen Medien entwickelt sich Natsume von einem einsamen, eigenständigen Individuum zu jemandem, der gegenseitige Abhängigkeit akzeptiert. Er wechselt von der Angst vor seiner Fähigkeit dazu, sie als Brücke zwischen Welten zu schätzen, um Yokai in Not zu helfen und Konflikte zu vermitteln. Er konfrontiert Gegner wie Matoba, der ihn zu Exorzistentreffen erpresst, bleibt aber seinen Prinzipien treu. Rückblenden zu Kindheitstraumata – wie das vergebliche Rufen nach seinem verstorbenen Vater oder der Verrat durch den Baum-Yokai – verlieren an Macht, während er Vertrauen zu seiner Wahlfamilie und Freunden aufbaut. Sein anfänglicher Wunsch nach Normalität wandelt sich in die Akzeptanz seiner einzigartigen Rolle, wobei er sowohl freudige als auch schmerzhafte Erfahrungen als unersetzliche Teile seines Lebens betrachtet.