Black Jack besteigt einen Unterwasserzug, um Detective Shunsaku Ban zu verfolgen und eine ausstehende Zahlung für die Behandlung von dessen Schusswunde einzutreiben – eine Praxis, die seinem Ruf, hohe Honorare zu fordern, entspricht. Während der Reise demonstriert er sein außergewöhnliches chirurgisches Können, als er eine Notfall-Hirnoperation an dem schwer verletzten Wissenschaftler Dr. Narzenkopf durchführt, nachdem dieser in einen Konflikt mit Waffenschmugglern geriet. Dies unterstreicht Black Jacks Fähigkeit, komplexe Eingriffe unter extremen Bedingungen durchzuführen.

Er beteiligt sich aktiv am Überlebenskampf der Passagiere, als sich die Krisen an Bord des Zuges zuspitzen und sie schließlich in der antiken Zivilisation von Mu stranden. Nach der Niederlage des Zauberers Sharaku in der Vergangenheit entscheidet er sich, vorübergehend in der Ära von Mu zu bleiben, um die Verletzten zu behandeln – ein Zeichen von Verantwortungsbewusstsein trotz seiner üblichen geldorientierten Art.

Sein Erscheinungsbild ist geprägt von seinem markanten schwarz-weißen Haar und sichtbaren Narben am ganzen Körper, besonders im Gesicht. Diese stammen von einem Landminen-Unfall in seiner Kindheit, bei dem seine Mutter ums Leben kam und sein Körper schwer verletzt wurde. Dr. Jotaro Honma behandelte diese Verletzungen und inspirierte ihn damit, Chirurg zu werden. Black Jack praktiziert ohne medizinische Lizenz, die er wegen Ungehorsams verlor, als er einen Patienten gegen Anweisung rettete. Obwohl er normalerweise exorbitante Honorare verlangt, folgt er einem komplexen Moralkodex und führt Operationen auch kostenlos durch, wenn ihn das Leid eines Patienten tief berührt. Er ist äußerst aufmerksam, kann schnell Diagnosen stellen und setzt seine chirurgischen Instrumente präzise ein, manchmal auch zur Verteidigung. Er lebt mit Pinoko zusammen, einer adoptierten Tochter, die er aus einem teratomatösen Zystom erschuf.