Musashi Miyamoto ist der primäre Antagonist von Baki-Dou: Der unbesiegbare Samurai. Er ist ein legendärer Samurai des siebzehnten Jahrhunderts, der durch eine Kombination aus Klontechnologie und spirituellem Eingreifen in der modernen Ära wiederbelebt wurde. Nachdem seine mumifizierte Leiche exhumiert wurde, wurde aus seiner Wirbelsäule extrahierte DNA verwendet, um einen neuen Körper zu züchten. Der leere Klon wurde dann von der Geistermedium Sabuko Tokugawa mit seiner ursprünglichen Seele erfüllt, wodurch seine Erinnerungen und Fähigkeiten wiederhergestellt wurden. Dieser Prozess wurde von Mitsunari Tokugawa, dem exzentrischen Milliardär und Nachkommen des Tokugawa-Clans, dem Musashi einst diente, finanziert und überwacht.

Musashi wurde während der Sengoku-Ära Japans geboren und tötete seinen ersten Gegner mit dreizehn Jahren. Er blieb in zweiundsechzig aufgezeichneten Duellen ungeschlagen und schuf seinen eigenen Schwertkampfstil, bekannt als Niten Ichi-ryu, bei dem zwei Klingen wie eine geführt werden. Er verfasste Das Buch der fünf Ringe und starb im Alter von einundsechzig Jahren an Lungenkrebs. In der Serie wird er als stark fiktionalisierte und dramatisierte Version der historischen Figur dargestellt, wobei seine Fähigkeiten übertrieben sind, um in die Welt von Baki zu passen.

In Bezug auf die Persönlichkeit ist Musashi äußerst direkt und handelt als ehrgeiziger, ruhmsuchender Künstler der Kampfkünste, der den Ruhm, den er einst hatte, zurückgewinnen möchte. Er ist geistig von der restlichen Welt distanziert, noch mehr als der prähistorische Kämpfer Pickle, und hat Schwierigkeiten, sich an die moderne Zeit anzupassen. Seine Denkweise ist durch einen Mangel an Mitgefühl für andere verzerrt, und er erwägt nur, die zu verschonen, die er bemitleidet. Er geht selten aufs Ganze und verspottet stattdessen die meisten seiner Gegner. Trotzdem hat er einen Ehrenkodex: Er wird die Gewalt eines Gegners mit gleicher Gewalt erwidern. Wenn ein Kämpfer ihn eins zu eins ohne Tötungsabsicht herausfordert, wird er ihn besiegen, ohne ihn zu töten. Wenn jedoch mehrere Gegner ihn mit Tötungsabsicht angreifen, behandelt er die Begegnung als Krieg und zeigt keine Gnade. Er respektiert Gegner, die sich ihm in einem ordentlichen Wettkampf stellen.

Musashis Hauptmotivation ist es, seinen Platz in einer Welt zu finden, die kein Schlachtfeld mehr hat, wie er es einst kannte. Er sucht danach, die Überlegenheit seiner alten Schwertkunst gegenüber modernen Kampfkünsten zu beweisen und den Ruhm und die Ehre seines legendären Status zurückzugewinnen. Er demontiert systematisch die stärksten Kämpfer Japans, um die Vorherrschaft seines Stils zu demonstrieren.

Seine Rolle in der Geschichte ist die der ultimativen historischen Bedrohung. Seine Wiederbelebung stört die gesamte Hierarchie der Kampfkunstwelt und zwingt Charaktere wie Baki Hanma, Yujiro Hanma und die anderen Underground-Arena-Kämpfer, sich einer Philosophie des Kampfes zu stellen, die jede Begegnung als Duell auf Leben und Tod betrachtet, nicht als Sport oder Kraftprobe. Er ist der Katalysator für den gesamten Handlungsbogen von Baki-Dou.

Zu den wichtigsten Beziehungen gehört seine tödliche Rivalität mit Izo Motobe, einem Meister des Jujutsu und traditioneller Waffen, der die Realität des bewaffneten Kampfes versteht. Motobe fungiert als selbsternannter Beschützer der modernen Kämpfer vor Musashis Tötungsabsicht. Seine Rivalität mit Retsu Kaioh wird zu einem entscheidenden Moment, da Retsu ihn herausfordert, um den Wert der chinesischen Kampfkünste zu beweisen, was zu einem tragischen Ausgang führt. Er hegt auch gegenseitigen Respekt mit Yujiro Hanma, dem stärksten Geschöpf der Erde, der Musashis Macht anerkennt. Seine Konfrontation mit Baki Hanma zwingt Baki, seine waffenlose Philosophie anzupassen, um einem Mann gegenüberzutreten, der Kampf als Gemetzel betrachtet. Er trifft auf Pickle, den prähistorischen Menschen, und stellt fest, dass der Kampf gegen ihn fesselnder ist, weil er mehrere Schnitte aushalten kann.

Musashi durchläuft keine signifikante persönliche Entwicklung im konventionellen Sinne; vielmehr erforscht sein Handlungsbogen seinen Versuch, seinen Platz in der modernen Welt zu finden und sein systematisches Testen der stärksten Kämpfer. Seine statische Natur steht im Kontrast zur Entwicklung derer um ihn herum.

Bemerkenswerte Fähigkeiten umfassen seine überragende Schwertkunst und die Erschaffung des Niten Ichi-ryu-Stils. Er besitzt eine Technik namens Imitationsschnitt, die es ihm ermöglicht, Gegner fühlen zu lassen, als wären sie geschnitten worden, und echten Schmerz zu erleben, ohne sie physisch zu berühren. Diese Sinnestäuschung ist ein Spiegelbild seiner unglaublichen Fertigkeit. Er kann Gegner mit einem einzigen Schlag töten, verlässt sich jedoch hauptsächlich auf seine Schwertkunst. Sein Körper ist immens widerstandsfähig, kann mächtige Schläge von Retsu Kaioh, Hanayama und Pickle aushalten und einen zweihunderttausend Volt starken elektrischen Schlag überstehen. Er hat eine unglaubliche Griffstärke, vergleichbar mit Kaoru Hanayama, und kann Gegner mühelos hochheben, selbst bei mechanischem Nachteil. Er kann die Haut der zähesten Kämpfer der Serie durchschneiden, einschließlich Pickle und Yujiro Hanma. Er ist ein Schlachtfeldgenie mit hoher Intelligenz, das jede Situation analysieren und sich anpassen kann. Seine Geschwindigkeit ist außergewöhnlich und erlaubt es ihm, zu handeln, bevor Gegner reagieren können. Er ist auch ein Meister mehrerer Kampfkünste seiner Zeit und kann seinen Kampfstil an die Herangehensweise jedes Gegners anpassen.