Joe Logan ist die zentrale Figur der Geschichte, ein ehemaliger Ninja, dessen richtiger Name Higan ist. Nachdem er seinem Clan entkommen war, nahm er den Decknamen Joe Logan an und suchte ein friedliches Leben im ländlichen Amerika, in der Hoffnung, sich vor seiner gewalttätigen Vergangenheit zu verstecken. Er lebte mit seiner Frau, Mari oder Sara, und ihrem Sohn Ren, arbeitete als Bauer und strebte danach, ein entspannter Familienvater zu sein, der sein ruhiges Dasein schätzte. Dieses friedliche Leben wurde jedoch zerstört, als sein Clan ihn aufspürte und seine Frau und sein Kind brutal ermordete, wobei Joe tot zurückgelassen wurde.

Getrieben von einem brennenden Verlangen nach Rache überlebt Joe seine schweren Verletzungen und erhebt sich aus seinem vermeintlichen Tod als der unerbittliche Ninja, der er einst war. Seine Hauptmotivation ist es, den Ninja-Clan und seinen Anführer Yamaji, der den Angriff auf seine Familie befohlen hatte, zu vernichten. Diese Suche verwandelt ihn von einem friedlichen Bauern in eine unaufhaltsame Kraft der Vergeltung, angetrieben von Trauer und purer Wut. Während seiner Reise interagiert er mit den FBI-Agenten Mike Moriss und Emma Samanda, die die Morde untersuchen und in seinen blutigen Krieg gegen den Clan verwickelt werden.

Joe Logan ist ein außergewöhnlich mächtiger und hochqualifizierter Ninja. Zu seinen Fähigkeiten gehören übermenschliche Geschwindigkeit, immense Stärke und meisterhafte Fertigkeit mit Klingenwaffen. Er ist auch in der Lage, eine einzigartige Ninja-Kunst namens Secret Stark of Awareness einzusetzen, die sich als rauchähnliche Substanz manifestiert, die seine Gegner desorientiert und seine eigenen Kräfte verstärkt, obwohl die wiederholte Anwendung seinen Körper belastet. Seine Widerstandsfähigkeit ist bemerkenswert; er wurde als scheinbar unfähig zu sterben bezeichnet, kann sich wiederbeleben und weiterkämpfen, selbst nachdem er tödliche Wunden erlitten hat. Im Verlauf der Erzählung sieht man seine Entwicklung, wie er seine Identität als Ninja Kamui vollständig zurückerobert, seine friedliche Fassade ablegt und das volle, erschreckende Ausmaß seiner Fähigkeiten als Krieger demonstriert.