Im Jahr 2050 ist Tokio zu einer Gesellschaft geworden, die auf Meta Reality (MR) aufbaut, einer Technologie, die die reale und die virtuelle Welt verschmelzen lässt. Die Menschen nutzen MR-Chips, die in ihre Gehirne implantiert sind, um mit einer nahtlosen erweiterten Umgebung zu interagieren, was den Alltag bequemer und komfortabler macht als je zuvor. Die Ausnahme ist Taiki, ein Oberschüler im ersten Jahr, der an einem angeborenen, unerklärlichen MR-Fehler leidet. Dadurch funktionieren MR-Anzeigen um ihn herum nicht richtig, was ständig Probleme verursacht und ihn von der vollständig immersiven Welt isoliert, die seine Altersgenossen genießen.

Die Geschichte beginnt mit Gerüchten über einen fliegenden Geist – eine Reihe von MR-Avatar-Selbstmorden, bei denen Avatare von hohen Orten springen. Bei der Untersuchung dieser Vorfälle folgt Taiki einer Spur zu einem Dach, wo er ein mysteriöses Mädchen trifft, das sich Lily nennt. Sie ist eine hochentwickelte künstliche Intelligenz, ein Robochika-Wesen, das nur als vollständige MR-Entität existiert. Als Taiki ihr zum ersten Mal begegnet, begrüßt sie ihn mit den Worten: „Ich habe dich warten lassen, Mensch.“ Nach einem versuchten MR-Verbindungsversuch mit Taiki, der aufgrund seines Fehlers schiefgeht, verliert Lily einen Großteil ihrer Kraft und ist gezwungen, bei ihm zu bleiben, während sie nach einem Weg sucht, ihre ursprünglichen Fähigkeiten wiederherzustellen. Trotz ihres eleganten Aussehens ist sie direkt, selbstgefällig und sagt genau das, was sie denkt. Sie entwickelt eine Vorliebe für Dampfbrötchen.

Taikis Kindheitsfreundin Kurumi, ein fröhliches und beliebtes Mädchen, wird verwickelt, nachdem ihr MR-Haustier verrückt spielt. Sie findet wieder Kontakt zu Taiki und schließt sich ihm und Lily an. Asato, ein Klassenkamerad, der offen Menschen nicht mag und seine Zeit lieber als halb zurückgezogener MR-Gamer verbringt, wird ebenfalls hineingezogen. Er hat das Robochika-Phänomen auf eigene Faust erforscht und verehrt die Idee einer perfekten KI wie Lily fast. Er stellt sein Zuhause als Operationsbasis zur Verfügung. Gemeinsam bilden die vier das Team Level Robochica (oder Team Re:bel Robotica).

Der zentrale Konflikt dreht sich um Kiramon – MR-Monster, die einst Menschen waren. Diese Wesen entstehen aus der „Dunkelheit des Herzens“ realer Menschen und manifestieren sich in MR als Bedrohungen. Taiki entdeckt trotz seines Fehlers, dass seine Unfähigkeit, MR normal zu sehen, tatsächlich eine Stärke im Kampf gegen diese Wesen sein könnte. Seine einzigartige Perspektive und Lilys KI-Fähigkeiten ergänzen sich und verwandeln seinen vermeintlichen Makel in eine Waffe. Das Team untersucht verschiedene MR-bezogene Vorfälle, die jeweils die emotionalen Kämpfe der Menschen hinter den Kiramon offenbaren. Die Handlungsbögen umfassen die Verfolgung des fliegenden Geistes, die Suche nach einem vermissten MR-Haustier und die Konfrontation mit Klassenkameraden, die in MR auf mysteriöse Weise stummgeschaltet sind. Jeder Fall zwingt Taiki und die anderen, sich den verborgenen Schmerzen anderer und ihrer selbst zu stellen.

Der Band führt auch das größere Geheimnis des Robochika-Systems selbst ein – was Lily wirklich ist, warum sie ihre Kraft verloren hat und was mit dem vorherigen Menschen geschah, der möglicherweise mit ihr verbunden war. Die Ermittlungen des Teams in Shibuya und im alten Archivgebäude deuten auf eine tiefere Verschwörung hin, die die Grenzen zwischen menschlichen Emotionen und künstlicher Intelligenz betrifft. Am Ende des Romans haben Taiki und Lily eine unzerbrechliche Bindung aufgebaut, und das Team ist bereit, sich den eskalierenden Bedrohungen in einer nahen Zukunft zu stellen, in der die Grenze zwischen Realität und Virtualität so zerbrechlich ist wie das menschliche Herz.