"Flock of Angels" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Menschheit von einer mysteriösen Bedrohung heimgesucht wird. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe junger Menschen, die in einer postapokalyptischen Welt ums Überleben kämpfen. Die Protagonisten sind Mitglieder einer Organisation namens "Engelsflügel", die sich der Bekämpfung der unbekannten Gefahr widmet. Diese Organisation besteht aus Individuen, die über besondere Fähigkeiten verfügen, die sie von gewöhnlichen Menschen unterscheiden.

Die Hauptfigur ist ein junger Mann namens Kaito, der nach dem Verschwinden seiner Schwester beschließt, sich den "Engelsflügeln" anzuschließen. Kaito besitzt die Fähigkeit, Energie zu manipulieren, was ihn zu einem wertvollen Mitglied der Gruppe macht. Neben ihm gibt es weitere Schlüsselcharaktere wie Yuna, eine strategisch denkende Anführerin, und Ryo, einen ruhigen und analytischen Kämpfer. Jeder Charakter hat eine eigene Hintergrundgeschichte, die ihre Motivationen und Handlungen im Laufe der Serie prägt.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Missionen, bei denen die Gruppe gegen die mysteriösen Feinde kämpft, die als "Schattenwesen" bezeichnet werden. Diese Wesen scheinen aus einer anderen Dimension zu stammen und bedrohen die verbliebene Zivilisation. Im Verlauf der Serie werden Hinweise auf die Herkunft der Schattenwesen und ihre Verbindung zur Menschheit aufgedeckt. Gleichzeitig gibt es interne Konflikte innerhalb der "Engelsflügel", da nicht alle Mitglieder die gleichen Ziele verfolgen.

Ein wiederkehrendes Thema ist die Frage nach dem Preis des Überlebens und der moralischen Grenzen, die im Kampf gegen eine übermächtige Bedrohung überschritten werden. Die Serie kombiniert Action, Drama und Science-Fiction-Elemente, wobei die Charakterentwicklung und die zwischenmenschlichen Beziehungen im Mittelpunkt stehen. Die Handlung ist durchsetzt mit unerwarteten Wendungen, die die Dynamik der Gruppe und ihre Beziehung zur Außenwelt beeinflussen.