Die Manga-Serie "Metroid" basiert auf der gleichnamigen Videospielreihe und erzählt die Geschichte der intergalaktischen Kopfgeldjägerin Samus Aran. Die Handlung beginnt mit Samus' Kindheit, in der sie Zeugin der Zerstörung ihrer Heimatkolonie durch die Space Pirates wird. Ihre Eltern kommen dabei ums Leben, und sie wird von den Chozo, einer alten und hochtechnologisierten Alienrasse, gerettet. Die Chozo nehmen Samus auf und modifizieren ihren Körper mit genetischen und biomechanischen Verbesserungen, um sie zu einer übermenschlichen Kriegerin zu machen.

Nach Jahren des Trainings und der Vorbereitung wird Samus zur Kopfgeldjägerin und nimmt Aufträge im gesamten Universum an. Ein zentraler Handlungsstrang dreht sich um ihre Konfrontation mit den Space Pirates, die weiterhin Chaos verbreiten und biologische Waffen entwickeln. Dabei stößt Samus auf die Metroiden, mysteriöse und gefährliche Lebensformen, die von den Space Pirates für ihre eigenen Zwecke missbraucht werden. Die Metroiden spielen eine Schlüsselrolle in der Handlung, da sie sowohl als Bedrohung als auch als potenzielles Werkzeug für die Rettung oder Zerstörung von Welten dienen.

Ein weiterer wichtiger Aspekt der Geschichte ist Samus' Beziehung zu ihrem Erzfeind, dem Parasiten Ridley, dem Anführer der Space Pirates. Ridley ist direkt verantwortlich für den Tod ihrer Eltern, und ihre Rivalität zieht sich durch die gesamte Serie. Samus' Charakter wird durch ihre Entschlossenheit, ihre Vergangenheit zu überwinden, und ihren unerschütterlichen Willen, das Universum zu schützen, geprägt.

Die Handlung ist geprägt von Action, Science-Fiction-Elementen und einer düsteren Atmosphäre. Samus durchquert verschiedene Planeten und Umgebungen, kämpft gegen Feinde und löst Rätsel, um ihre Missionen zu erfüllen. Dabei wird ihre Rolle als einsame Kriegerin betont, die trotz ihrer Stärke und Fähigkeiten mit ihrer Vergangenheit und Einsamkeit kämpft. Die Serie verbindet persönliche Konflikte mit epischen intergalaktischen Schlachten und erkundet Themen wie Rache, Pflicht und die moralischen Grauzonen von Krieg und Technologie.