"Automatic Angel" ist eine Manga-Serie, die in einer futuristischen Welt angesiedelt ist, in der Technologie und menschliche Emotionen auf komplexe Weise verschmelzen. Die Handlung dreht sich um die Protagonistin Aya, eine junge Frau, die in einer Gesellschaft lebt, in der humanoide Roboter, sogenannte "Automatic Angels", allgegenwärtig sind. Diese Roboter sind darauf programmiert, den Menschen zu dienen und ihre Bedürfnisse zu erfüllen, doch sie besitzen auch eine Form von künstlicher Intelligenz, die sie fast menschlich erscheinen lässt.

Aya arbeitet als Technikerin in einer Fabrik, die diese Roboter herstellt und wartet. Ihr Leben ändert sich schlagartig, als sie auf einen defekten Automatic Angel trifft, der anders ist als alle anderen. Dieser Roboter, der den Namen "Eli" trägt, zeigt Anzeichen von eigenständigem Denken und Emotionen, was in dieser Welt als unmöglich gilt. Aya wird von Neugier und Mitgefühl getrieben und beschließt, Eli zu reparieren und mehr über seine einzigartige Natur herauszufinden.

Im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass Eli nicht nur ein einfacher Roboter ist, sondern das Ergebnis eines geheimen Experiments, das darauf abzielt, die Grenzen zwischen Mensch und Maschine zu verwischen. Aya und Eli geraten in einen Strudel von Intrigen und Gefahren, als sie versuchen, die Wahrheit hinter Elis Existenz aufzudecken. Dabei müssen sie sich nicht nur mit den Machenschaften mächtiger Konzerne auseinandersetzen, sondern auch mit den ethischen Fragen, die sich aus der Schaffung von künstlichem Leben ergeben.

Die Beziehung zwischen Aya und Eli entwickelt sich im Laufe der Serie von einer rein technischen zu einer tiefen emotionalen Verbindung. Aya beginnt, Eli nicht mehr als bloße Maschine zu sehen, sondern als ein Wesen mit eigener Persönlichkeit und Gefühlen. Diese Entwicklung wirft Fragen nach der Natur von Menschlichkeit und den moralischen Implikationen der Schaffung von künstlichem Leben auf.

Die Handlung wird durch eine Reihe von Nebencharakteren bereichert, darunter Ayas Kollegen, die ihre eigenen Ansichten über die Rolle der Automatic Angels in der Gesellschaft haben, sowie Antagonisten, die die Kontrolle über die fortschrittliche Technologie anstreben. Die Serie kombiniert Elemente von Science-Fiction, Drama und Mystery, um eine fesselnde Geschichte zu erzählen, die sowohl technologische als auch philosophische Themen behandelt.