Einige Monate nach seiner ersten Begegnung mit dem verlorenen Geist Mayoi Hachikuji findet sich Koyomi Araragi außerstande, die junge Dame zu finden, um ihren Rucksack zurückzugeben. Aufgebend kehrt er nach Hause zurück, nur um festzustellen, dass er am letzten Tag der Ferien seine gesamte Sommerhausaufgaben vernachlässigt hat. In seiner Verzweiflung wendet er sich an die ehemalige Vampirin Shinobu Oshino, die in seinem Schatten residiert, und bittet sie um Hilfe, um einen Tag in die Vergangenheit zu reisen. Shinobu stimmt zu, doch der Plan geht spektakulär schief, und das Duo verfehlt sein Ziel, landet elf Jahre in der Vergangenheit am 13. Mai, dem Tag vor dem Muttertag, an dem Mayoi Hachikuji bei einem Autounfall ums Leben kam.

Koyomi erkennt das Datum und sieht eine Chance, die Geschichte zu ändern und Mayoi vor ihrem Schicksal zu bewahren, wobei er Shinobus strenge Warnungen über die unvorhersehbaren Folgen einer Veränderung der Vergangenheit ignoriert. Nach erfolgreichem Eingreifen und der Sicherstellung, dass das Mädchen das Haus ihrer Mutter erreicht, versuchen Koyomi und Shinobu, in ihre eigene Zeit zurückzukehren. Allerdings gelangen sie in eine gegenwärtige Welt, die völlig verwüstet ist. Die Stadt ist öde und von Horden von Zombies, verwandelten Menschen, die nachts durch die Ruinen streifen, verseucht.

Das Duo entdeckt bald die katastrophalen Folgen ihres Handelns. Weil Mayoi nie starb, wurde sie nie zu dem wandernden Geist, mit dem Koyomi sich anfreundete. Ohne diese Freundschaft bemerkte Koyomi nie, dass Shinobu von der Nachhilfeschule weglief, fand sie nicht und wurde anschließend von Black Hanekawa getötet. Der Verlust ihres einzigen Gefährten trieb die Shinobu dieser alternativen Zeitlinie, nun vollständig als legendärer Vampir Kiss-Shot Acerola-Orion Heart-Under-Blade wiederhergestellt, dazu, alle Hoffnung zu verlieren und ihre Macht zu entfesseln, mit dem Schwur, die Welt zu zerstören, indem sie die gesamte Menschheit in ihre Diener, oder Jiangshi, verwandelt. Der Hauptkonflikt verlagert sich von der Erledigung der Hausaufgaben auf Überleben und Sühne, da Koyomi und seine Shinobu einen Weg finden müssen, dem alternativen, gottgleichen Kiss-Shot gegenüberzutreten und das Gefüge der Zeit zu reparieren. Unterwegs treffen sie auf eine abgehärtete, 21-jährige Version von Mayoi, die gelernt hat, ums Überleben zu kämpfen, und eine entscheidende Botschaft von Meme Oshino aus der alternativen Zeitlinie überbringt.

Die Hauptcharaktere sind Koyomi Araragi, ein gutmütiger aber impulsiver Oberstufenschüler, der noch einige vampirische Regenerationsfähigkeiten besitzt; Shinobu Oshino, ein uralter, mächtiger Vampir, der auf die Gestalt eines jungen Mädchens zurückgefallen ist und eine tiefe, stille Bindung mit Koyomi teilt; und Mayoi Hachikuji, der Geist eines jungen Mädchens, das auf dem Weg zum Haus ihrer Mutter verloren ging und dessen Schicksal der Katalysator für die Tragödie der Geschichte ist. Yotsugi Ononoki, eine seltsame, ausdruckslose puppenähnliche Erscheinung, tritt ebenfalls zu Beginn auf, um die Gefahren des Eingreifens in die Existenz anzudeuten.

Die Erzählung ist um den Mayoi Jiangshi-Bogen strukturiert, eine düstere Erkundung von Zeitreisen und deren Auswirkungen. Die Geschichte bewegt sich von der vertrauten Kulisse der Stadt und dem Nadeko Snake Shrine, der für die Zeitreise genutzt wird, zu einer öden, postapokalyptischen Version derselben Stadt, die von Untoten überrannt ist. Der Bogen dient als entscheidender Wendepunkt, der Koyomi zwingt, das Gewicht seiner heldenhaften Impulse zu konfrontieren und grundlegend die Tiefe seiner Beziehung zu Shinobu zu erforschen, während die gesamte Welt am seidenen Faden ihrer Fehler hängt. Der Titel Kabukimonogatari bezieht sich auf eine "schräge" oder "geneigte" Haltung gegenüber der Welt, die Haltung eines Dandys, was den unkonventionellen, bohèmehaften Ansatz der Protagonisten im Umgang mit übernatürlichen Abweichungen perfekt beschreibt.